Fraunhofer-Institut für Integrierte Schaltungen IIS
Fraunhofer-Institut für Integrierte Schaltungen IIS
MIKAIA – Development

Wir sind Ihr Partner für die medizinische Bildanalyse

Auftragsentwicklung medizinische Bildanalyse

Unser Profil

Wir sind ein Team aus Bioinformatikerinnen und -informatikern mit langjähriger Erfahrung und Erfolgsbilanz in der Verarbeitung und Analyse medizinischer Bilder, insbesondere in den Bereichen

  •  Mikroskopie
  •  Endoskopie
  •  Ophthalmologie
  •  und in benachbarten Disziplinen.

Durch die Zusammenarbeit in interdisziplinären Teams haben wir uns medizinische Fachkenntnisse erworben (Pathologie, Biologie, Zytologie, Hämatologie, Endoskopie, Ophthalmologie).

Ihre Vorteile mit uns als F&E-Partner

In der Regel werden wir in den frühen Phasen der Entwicklung von Medizinprodukten hinzugezogen. Mit Arbeitsschwerpunkt auf echtzeitfähigen Bildanalyseverfahren und Mikroskopie- sowie Scanningsystemen unterstützen wir Sie vom ersten Schritt und bis zur kompletten Systemkonzeption.

 

Unsere anwendungs- und kundenspezifischen Lösungen und Dienstleistungen umfassen

  • Durchführung von Workshops
  • Beratung
  • Machbarkeitsstudien
  • Bildanalyse als Dienstleistung
  • Algorithmen- und KI-Entwicklungen
  • Softwareentwicklung von Anwendungen oder Bibliotheken
  • Anpassung und Re-Branding unser bestehenden Softwares

Unsere Kompetenzen umfassen

  • (Klassische) Computer Vision und KI (CNNs, Transformers)
  • Entwicklung neuer Algorithmen
  • Training neuer KI
  • Code-Optimierung auf Geschwindigkeit (GPGPU, Multi-Threading, Cloud)  

 

Referenzprojekte für die internationale Industrie

  • Software-Entwicklung für einen Anbieter von Pathologiescannern (Echtzeit-JPEG 2000 Bildkomprimierung auf der GPU, Erstellung von Whole-Slide-Images, Viewer, Annotationssystem)
  • Forschung und Entwicklung von KI und Software für die primäre Bildanalyse für einen Gerätehersteller im Bereich Spatial Biology
  • Entwicklung von Bildanalysesoftware für einen Anbieter von Fluoreszenzmikroskopen und Scannern
  • Forschung und Entwicklung einer Echtzeit-3D-Darmrekonstruktion für monoskopische Koloskopien für einen Anbieter von klinischen Dokumentationssystemen
  • Forschung und Entwicklung von Echtzeit-Polypenerkennung und -klassifizierung für monoskopische Kolonoskope für Anbieter von klinischen Dokumentationssystemen
  • Entwicklung einer Echtzeit-Videooptimierung für Glasfaser-Endoskope eines Endoskopherstellers, lauffähig auf älterer Hardware
  • Konzept und Architekturdesign eines neuartigen, KI-gestützten, digitalen Endoskopieturms für einen Endoskophersteller
  • Statistische Analyse und Auswertung zur Ausbreitung von Nasenspray in der Mund- und Nasenhöhle für ein CRO
    Entwicklung eines Algorithmus zur Extraktion von hochqualitativen Fundusbildern mittels eines handgehaltenen, digitalen Ophthalmoskopvideos (iPhone) für einen Ophthalmologie-Anbieter
  • Machbarkeitsstudie für eine KI-basierte Identitätsprüfung zwischen Irisbildern, die mit verschiedenen Geräten bei unterschiedlichen Spektren und Lichteinstellungen aufgenommen wurden, für einen Ophthalmologie-Anbieter
  • Forschung und Entwicklung von Autofokus sowie Machbarkeitsstudie für Echtzeit-3D-Stitching für einen Anbieter von digitalen Stereokolposkopen

 

Unsere Infrastruktur

Digital-Pathology-Labor

  • Mikroskopie: Zeiss Axio Scan.Z1, Motic EasyScan, PreciPoint M8 Scanner, Fraunhofer SCube, Zeiss AxioImager FL Mikroskop (weitere Scanner sind über unsere klinischen Partner verfügbar)
  • Annotieren & Berechnen: professionelle Bildanalyselösungen (MIKAIA® , HALO von Indica Labs), WACOM-Tablet für die Annotation von Objektträgern, SlideMatch für die Registrierung von konsekutiven oder "re-stained" Schnitten


Endoskopie-Labor

  • Mehrere Mono- und Stereo-, starre und flexible Endoskope (Wolf, Storz, Schölly, Olympus), verschiedene Lichtquellen, Roboterarm
  • Diverse Phantome
  • 3D-Drucker


Deep Learning Cluster: 34 Nodes, 72x NVidia P100 GPU, 16x NVidia P40 GPU, 2,8 TB RAM


Umfangreiches Partnernetzwerk aus Kliniken, Hochschulen und Industrie