Medical Image Analysis – Our Publications and Downloads

• Petr Kuritcyn, Rosalie Kletzander, Sophia Eisenberg, Thomas Wittenberg, Volker Bruns, Katja Evert, Felix Keil, Paul K. Ziegler, Katrin Bankov, Peter Wild, Markus Eckstein, Arndt Hartmann, Carol I. Geppert, Michaela Benz, Towards interactive AI-authoring with prototypical few-shot classifiers in histopathology,
  Journal of Pathology Informatics, June 2024, https://doi.org/10.1016/j.jpi.2024.100388, 
• Volker Bruns, Petr Kuritcyn, Rosalie Kletzander, Michaela Benz, Thomas Wittenberg, Carol Geppert
  Interactive generic analysis of H&E slides using a combination of multiple Ais, 20th Europ. Congress on Digital Pathology (ECDP), Vilnius, Lithuania, June 2024
  online: https://www.ecdp2024.org/ECDP2024_program.pdf
• Volker Bruns, Michaela Benz , Julia Hetzel, Anke Hoffmann, Katja Evert, Carol Geppert, IHC Cell Analysis – More than just Cell Counting: A proposed Workflow,
  20th Europ. Congress on Digital Pathology (ECDP), Vilnius, Lithuania, June 2024, online: https://www.ecdp2024.org/ECDP2024_program.pdf
• Neus Godino, Tobias Gerling, Felix Pfisterer, Nina Hupf, Daniel Graf, Jonas Herwing, Juliane Schulze, Sarah Schulenberg, Julia Hetzel, Rosalie Kletzander, Thomas Schoenfelder, Norbert Danz, Falk Kemper, Michael Schmueck-Henneresse, Michaela Benz and Michael Kirschbaum, Microfluidic microscope add-on for image-activated cell sorting, Int. Soc. For Advancement in Cytometry (ISAC) CYTO 2024
• Wiley Analytical Science: Das Mikroskop als Zellsortierer, https://analyticalscience.wiley.com/content/article-do/das-mikroskop-als-zellsortierer
• Trillium Pathology 2024: A growing number of AIs cleared for clinical use is finally available: The AI-assisted Pathologist, DOI: https://doi.org/10.47184/tp.2024.01.03
• 30.04.2024 Trillium Pathology 2024: Programming-free Image-Analysis Workflows for IHC, IF and Spatial Proteomics: More than just Cell Counting, DOI: https://doi.org/10.47184/tp.2024.01.06
• Michaela Benz, Petr Kuritcyn, Rosalie Kletzander, Volker Bruns, „Robust and Adaptive AI for Digital Pathology”, book chapter in “Unlocking Artificial Intelligence - From Theory to Applications", July 2024, https://doi.org/10.1007/978-3-031-64832-8_12
• Volker Bruns, Petr Kuritcyn, Rosalie Kletzander, Sophia Eisenberg, Michaela Benz: Computergestützte Pathologie als Do-it-yourself, Komplexe Bildanalysen ohne Programmierkenntnisse selbst durchführen, Wiley Analytical Science Magazine, 9. Oktober 2024: https://analyticalscience.wiley.com/content/article-do/computergest%C3%BCtzte-pathologie-als-do-yourself

Daniel Firmbach, Michaela Benz, Petr Kuritcyn, Volker Bruns, Corinna Lang-Schwarz, Frederik A. Stuebs, Susanne Merkel, Leah-Sophie Leikauf, Anna-Lea Braunschweig, Angelika Oldenburger, Laura Gloßner, Niklas Abele, Christine Eck, Christian Matek, Arndt Hartmann, Carol I. Geppert: Tumor–Stroma Ratio in Colorectal Cancer—Comparison between Human Estimation and Automated Assessment,  Cancers 2023, 15(10), 2675; https://doi.org/10.3390/cancers15102675 , PMID: 37345012

Thomas Eixelberger, Philip Maisch, Stephan Kruck, Sebastian Belle, Maximilian Kriegmair, Christian Bolenz, Thomas Wittenberg: Deep Learning by Domain Transfer for Early Tumor Detection in the Urinary Bladder, https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1014

Lukas Heinlein , Michaela Benz , Petr Kuritcyn , Volker Bruns , Arndt Hartmann , Felix Keil , Carol Geppert , Katja Evert und Thomas Wittenberg: Lymph node metastases detection in Whole Slide Images using prototypical patterns and transformer-guided multiple instance learning, Current Directions in Biomedical Engineering; https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1042

Ibrahim Ibrahim , Tobias Draeger und Thomas Wittenberg: Identification of Surgical Instruments Using a Low Frequency Magnetic Field, Current Directions in Biomedical Engineering; https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1015

Rosalie Kletzander, Petr Kuritcyn , Volker Bruns , Markus Eckstein , Carol Geppert , Arndt Hartmann und Michaela Benz: Domain Transfer in Histopathology using Multi-ProtoNets with Interactive Prototype Adaptation, Current Directions in Biomedical Engineering; https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1123

R. Kletzander1, M. Benz1, V. Bruns1, P. Kuritcyn1, D. Firmbach2, C. Matek2, C. I. Geppert2, A. Hartmann2, M. Eckstein: Interactive AI training with minimal annotations (page 138), Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie (DGP), 1.-3.6.2023; https://www.pathologie-dgp.de/media/Dgp/Jahrestagung-2022/DGPatho2023_Abstractband_final_Webversion.pdf

• F. Wilm, M. Benz, V. Bruns, S. Baghdadlian, J. Dexl, D. Hartmann, P. Kuritcyn, M. Weidenfeller, Th. Wittenberg, S. Merkel, A. Hartmann, M.  Eckstein, C. I. Geppert: "Fast whole-slide cartography in colon cancer histology using superpixels and CNN classification.” Journal of Medical Imaging, 9(2), 027501 (2022). https://doi.org/10.1117/1.JMI.9.2.027501, PMID: 35300344
  
• Th. Wittenberg, M. Benz, A. Foltyn, R. Hackner, J. Hetzel, V. Wiesmann und Th. Eixelberger: "Acquisition of Semantics for AI-based Applications in Medical Technologies." Current Directions in Biomedical Engineering 2021; 7(2); https://doi.org/10.1515/cdbme-2021-2131
  
• Volker Bruns, Michaela Benz, Carol Geppert: "Tissue Cartography for Colorectal Cancer."  Chapter 9: Artificial Intelligence Applications in Human Pathology, pp. 203-241 (2022); https://doi.org/10.1142/9781800611399_0009
• Jakob Dexl, Michaela Benz, Volker Bruns, Petr Kuritcyn, Thomas Wittenberg: "MitoDet: Simple and Robust Mitosis Detection." Conference Papaer; MICCAI 2021: Biomedical Image Registration, Domain Generalisation and Out-of-Distribution Analysis pp 53–57; DOI: 10.1007/978-3-030-97281-3_7
  
• Volker Bruns: "Digitale Transformation – Vom klassischen zum digitalen Pathologielabor". Sonderausgabe TDP 1/2022 Digitale Transformation
  
• Michaela Benz, Volker Bruns: "Parasiten mittels Webbrowser aufspüren." Management & Krankenhaus; Whitepaper
  
• R. Kletzander, D. Firmbach, V. Bruns, C. I. Geppert, A. Hartmann, M. Eckstein, M. Benz: "Few-Label Adaptation using Multi-ProtoNets – an Experiment on Urothelial Carcinomas." 18th European Congress on Digital Pathology (ECDP), Berlin, Germany, June 2022
  
• Bruns, V., Benz, M., Kuritcyn, P., Dexl, J., Wittenberg, T., Eckstein, M., Hartmann, A., Geppert, C., "Fast and Robust Deep Tissue Cartography for Colon Section." 105. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie (DGP), Münster, June 2022
• Eixelberger, T., Niedermair, T., Evert, K., Müller, B., Vermeulen, D., Steiger, K., Delbridge, C., Heimberg, W., Mayer, M., Schüffler, P., Weichert, W., Evert, M., Brochhausen-Delius, C., Bruns, V.: "Pre-Scan QC – Preliminary Results for Artefact Detection in Slide Overview Images." 105. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie (DGP), Münster, June 2022
• Thomas Eixelberger, Gabriel Wolkenstein, Ralf Hackner, Volker Bruns, Steffen Mühldorfer, Udo Geissler, Sebastian Belle, and Thomas Wittenberg: YOLO networks for polyp detection: A human-in-the-loop training approach." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
• Veronika Kress, Thomas Wittenberg, Martin Raithel, Volker Bruns, Edgar Lehmann, Thomas Eixelberger, and Ralf Hackner: "Automatic detection of foreign objects and contaminants in colonoscopic video data using deep leaning." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
• Jakob Dexl, Michaela Benz, Petr Kuritcyn, Thomas Wittenberg*, Volker Bruns, Carol Geppert, Arndt Hartmann, Bernd Bischl, and Jann Goschenhofer: "Robust Colon Tissue Cartography with Semi-Supervision." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
  
• Aliya Mohammed, Carol Geppert, Arndt Hartmann, Petr Kuritcyn, Volker Bruns, Ute Schmid, Thomas Wittenberg, Michaela Benz and Bettina Finzel: "Explaining and Evaluating Deep Tissue Classification by Visualizing Activations of Most Relevant Intermediate Layers." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
• Egbert Tannich, Birgit Förster, Christine Wegner, Ulrike Loderstädt, Volker Bruns, Michaela Benz, Christian Hammer, Christopher Kussin: "ParasiteWeb^® – A Web Platform for Training and Quality Assessment in Parasite Microscopy Comprising a Comprehensive Digitized Sample Collection." Conference on Tropical Medicine and Global Health (CTM), Rostock, Germany, June 2022  

• S. Walluscheck, Th. Wittenberg, V. Bruns, Th. Eixelberger, R. Hackner: "Partial 3D-reconstruction of the colon from monoscopic colonoscopy videos using shape-from-motion and deep learning" Current Directions in Biomedical Engineering, vol. 7, no. 2, 2021, pp. 335-338. https://doi.org/10.1515/cdbme-2021-2085
• V. Bruns, D. Franz, P. Kuritcyn, V. Wiesmann, M. Rathke, Th. Wittenberg, A. Wießner, L. Kursawe, A. Moter, J. Kikhney, Ch. Münzenmayer:"Towards computer aided diagnosis of infective endocarditis in whole-slide images of heart valve tissue using FISH" Current Directions in Biomedical Engineering, vol. 7, no. 2, 2021, pp. 468-471. https://doi.org/10.1515/cdbme-2021-2119
• Ralf Hackner, Rodrigo Suarez-Ibarrola, Tian Qiu , Niels Lemke , Philipp-Fabian Pohlmann, Konrad Wilhelm , Peer Fischer, Arkadiusz Miernik, Thomas Wittenberg: Panoramic Imaging Assessment of Different Bladder Phantoms - An Evaluation Study. Urology, Oct. 2021,DOI: 10.1016/j.urology.2021.05.036, PMID: 34087314
  
• J. Deuschel, D. Firmbach, C.I. Geppert, M. Eckstein, A. Hartmann, V. Bruns, P. Kuritcyn, J. Dexl, D. Hartmann, D.Perrin, Th. Wittenberg, M. Benz: Multi-Prototype Few-Shot Learning in Histopathology. 2021; proceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV) Workshops; pp. 620-628
• Th. Wittenberg, A. Friedrich, A. Wittenberg, St. von Delius, M. Raithel, Th. Eixelberger, S. Nowack: Initial experiments of eye-tracking during AI-assisted polyp-detection in colonoscopy. Article; Current Directions in Biomedical Engineering 2021;7(1): 20211134
  
• V. Bruns, R.Huss, P. Kuritcyn, M. Benz, A. Ebigbo, A. Probst, Ch. Palm, Th. Wittenberg, C. Geppert, A. Hartmann, H. Messmann, B. Märkl: Adapting an Adenocarcinoma-trained Tissue Cartography AI model to low- and high-grade adenoma. 06/08-12/2021; Poster; Virtuelle Pathologietage 2021
  
• Niedermair, B. Müller, D. Vermeulen, K. Steiger, C. Delbridge, K. Evert, K. Utpatel, M. Babel, F. Heimberg, M. Mayer, T. Eixelberger, V. Bruns, P. Schüffler, W. Weichert, M. Evert, C. Brochhausen: Digitalization of the workflows in pathology – process analyses as a fundamental approach for a successful roadmap (PathoScan).06/08-12/2021; Presentation; Virtuelle Pathologietage 2021
• Petr Kuritcyn, Michaela Benz, Jakob Dexl, Volker Bruns, Arndt Hartmann, Carol Geppert: Comparison of CNN models on a multi-scanner database in colon cancer histology. 07/07-09/2021; Presentation; Medical Imaging with Deep Learning; Lübeck
• Michaela Benz, Volker Bruns, Moritz Schillinger, Christian Hammer, Christopher Kussin, Verena Kaiser, Nathalie Wojtalewicz, Patrick Schwarz, Ingo Schellenberg, Ulrike Loderstädt, Christine Wegner, Birgit Förster, Egbert Tannich: A web-based platform for training and quality control of parasite microscopy. 07/09-12/2021; Abstract; ECCMID 2021
• Pantea Pour Farid, Markus Eckstein, Susanne Merkel, Robert Grützmann, Arndt Hartmann, Volker Bruns, Michaela Benz, Regine Schneider-Stock and Carol I. Geppert: Novel Criteria for Intratumoral Budding with Prognostic Relevance for Colon Cancer and Its Histological Subtypes , Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 13108. https://doi.org/10.3390/ijms222313108  ,PMID: 34884913  

• R. Hackner , S. Walluscheck, E. Lehmann, M. Raithel, V. Bruns, T. Wittenberg: AI-based 3D-reconstruction of the colon from monoscopic colonoscopy videos - First results. 12/2020; Conference; CARS 2020-Computer Assisted Radiology and Surgery Proceedings of the 34th International Congress and Exhibition; 
  
• Ralf Hackner and Sina Walluscheck; Edgar Lehmann, Thomas Eixelberger, Thomas Wittenberg: A Geometric and Textural Model of the Colon as Ground Truth for Deep-Learning Based 3D-Reconstruction. 11/2020; Bildverarbeitung für die Medizin 2021; Springer Professional;  Wiesbaden; ISBN: 978-3-658-33197-9
  
• Petr Kuritcyn, Carol I. Geppert, Markus Eckstein, Arndt Hartmann,
  Volker Bruns, Jakob Dexl, Serop Baghdadlian, David Hartmann,
  Dominik Perrin, Thomas Wittenberg, Michaela Benz: Robust slide cartography in colon cancer histology - Evaluation on a multi-scanner database. 11/2020; Article; Bildverarbeitung für die Medizin 2021; Springer Professional;  Wiesbaden; ISBN: 978-3-658-33197-9
  
• Steinert, J.; Wittenberg, T.; Bednarzig, V.; Detsch, R.; Claussen, J.; Gerth, S.: CT-based non-destructive quantification of 3D-printed hydrogel implants. 03/15/2020; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM); 119-124; Springer Fachmedien; DOI: 10.1007/978-3-658-29267-6_25
• Eixelberger, T.; Parchent, J.; Janka, R.; Stamminger, M.; Döllinger, M.; Wittenberg, T.: Haptic rendering of soft-tissue for training surgical procedures at the larynx. 3/15/2020; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM); 342-347; Springer Fachmedien; DOI: 10.1007/978-3-658-29267-6_76
• Weiherer, M.; Zorn, M.; Wittenberg, T.; Palm, C.: Retrospective color shading correction for endoscopic images. 3/15/2020; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM); 14-19; Springer Fachmedien; DOI: 10.1007/978-3-658-29267-6_3
• Ralf Hackner, Martin Raithel, Edgar Lehmann, Thomas Wittenberg: Deep-learning based reconstruction of the stomach from monoscopic video data. 03/2020; Article; Current Directions in Biomedical Engineering; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2020-3012
  
• Magnus Rathke, Pascal Zobel, Volker Bruns, Steffen Mühldorfer, Thomas Wittenberg (2020): Computer Assistierte Erkennung von Polypen mit tiefen Neuronalen Netzen. =1/2020; Abstract und Poster bei der DGE-BV 2020 in Würzburg, Endoscopy Campus (EC) Magazin, 1.2020; S. 80-81.
  https://www.endoscopy-campus.com/wp-content/uploads/ec-magazin-2020-01.pdf
• Thomas Wittenberg, Martin Raithel (2020): Artificial Intelligence-Based Polyp Detection in Colonoscopy – Where Do We Come from, Where Do We Stand, and Where Will We Go to? Article; Visceral Med. Visc Med 2020. DOI: 10.1159/000512438

• Weißkopf, Peter; Koch, Robert; Haßlmeyer, Erik; Hauenstein, Thomas; Wagner, Eugen; Lang, Nadine; Garbas, Jens- Uwe; Wittenberg, Thomas; Struck, Matthias: Robust contactless optical heart rate acquisition - measuring human perception in minimal invasive settings. 9/25/2019; Conference; Proceedings, Biomed. Eng.-Biomed. Tech. 2019 - Proceedings BMT 2019; DeGruyter Verlag; DOI 10.1515/bmt-2019-6023
• Rüger, Steffen; Firsching, Markus; Lucic, Julija; Ennen, Alexander; Uhlmann, Norman; Wittenberg, Thomas: Automated detection of bone splinters in DEXA phantoms using deep neural networks. 9/18/2019; Article; 281–284; Current Directions in Biomedical Engineering, Band 5; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2019-0071
• Zobel, Pascal; Rathke, Magnus; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Computer Aided Detection of Polyps in Whitelight- Colonoscopy Images using Deep Neural Networks. 9/18/2019; Article; 231-234; Current Directions in Biomedical Engineering, Band 5; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2019-0059
• Killguß, Nathalie; Wittenberg, Thomas; Rupp, Robin (ENT Clinics University Erlangen); Hofer, Mathias (University of Leipzig); Franz, Daniela; Eixelberger, Thomas: Interactive Image Segmentation for Cochlea Implant Planning based on DVT Data. 9/18/2019; Article;
  413–416; Current Directions in Biomedical Engineering 2019, Band 5; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2019-0104
• Bergler, Matthias; Benz, Michaela; Rauber, David; Hartmann, David; Kötter, Malte (Universitätsklinikum Erlangen); Eckstein, Markus (Universitätsklinikum Erlangen); Schneider-Stock, Regine (Universitätsklinikum Erlangen); Hartmann, Arndt (Universitätsklinikum Erlangen); Merkel, Susanne (Universitätsklinikum Erlangen); Bruns, Volker; Wittenberg, Thomas; Geppert, Carol (Universitätsklinikum Erlangen): Automatisierte Tumor Bud Quantifizierung in Pan-Cytokeratin gefärbtem Kolonkarzinom. 6/13/2019; Conference; Der Pathologe, Abstractband der 103. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie; 83-84; Springer Medizin
  
• Bruns, Volker; Eixelberger, Thomas; Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Mit allen Sinnen lernen: Auf dem Weg zur fehlerfreien Operation - Entwicklung eines virtuellen OP-Trainers zur Unterstützung von Chirurgen in der Neuro-, HNO- und MKG-Chirurgie. 5/1/2019; Article; 17-20; KU Gesundheitsmanagement
• Bergler, Matthias; Benz, Michaela; Rauber, David; Hartmann, David; Kötter, Malte (University Hospital Erlangen); Eckstein, Markus (University Hospital Erlangen); Schneider-Stock, Regine (University Hospital Erlangen); Hartmann, Arndt (University Hospital Erlangen); Merkel, Susanne (University Hospital Erlangen); Bruns, Volker; Wittenberg, Thomas; Geppert Carol (University Hospital Erlangen): Automatic Detection of Tumor Buds in Pan-Cytokeratin stained Colorectal Cancer Sections by a Hybrid Image Analysis Approach. 4/10/2019; Conference; Proceedings, 15th European Congress on Digital Pathology (ECDP 2019), Warwick, UK, Proceedings; Lecture Notes in Computer Science; 83-90; Springer International Publishing; DOI: 10.1007/978-3-030-23937-4_10
• Wittenberg, Thomas; Bruns, Volker; Wiesmann, Veit: Auswertung von Fluoreszenzmikroskopie Aufnahmen in der Medizin. 1/1/2019; Article; Fraunhofer Vision Nr. 19 - Leitfaden zur hyperspektralen Bildverarbeitung; Fraunhofer-Allianz Vision Leitfaden; 82-85; Fraunhofer Verlag, Stuttgart; ISBN: 978-3-8396-1502-7
• Bruns, Volker; Geppert, Carol (Universitätsklinikum Erlangen): Einsatz von Künstlicher Intelligenz in der digitalen Pathologie - Auf dem Sprung in die Routine? 1/1/2019; Article; 91-93; Trillium Diagnostik
• Klare, P.; Sander, C.; Prinzen, M.; Haller, B.; Nowack, S.; Abdelhafez, M.; Poszler, A.; Brown, H.; Wilhelm, D.; Schmid, R.M.; Delius, S. von; Wittenberg, T.: Automated polyp detection in the colorectum: A prospective study (with videos). 2019; Article; Gastrointestinal endoscopy 89, Nr.3; 576-582; DOI: 10.1016/j.gie.2018.09.042
• Eckstein, M.; Sailer, V.; Schnack Nielsen, B.; Wittenberg, T.; Wiesmann, V.; Lieb, V.; Nolte, E.; Hartmann, A.; Kristiansen, G.; Wernert, N.; Wullich, B.; Taubert, H.; Wach, S.: Co-staining of microRNAs and their target proteins by miRNA in situ hybridization and immunohistofluorescence on prostate cancer tissue microarrays. 2019; Article; Laboratory investigation 99, Nr.10, 1527-1534; DOI: 10.1038/s41374-019-0251-8
• Katanacho, Manuel; Beteiligt: Krüger, Jörg; Uhlmann, Eckart; Wittenberg, Thomas: Verfahren zur kamerabasierten Instrumentennavigation am Beispiel der HNO-Chirurgie. 2019; Dissertation; 139; Berichte aus dem Produktionstechnischen Zentrum Berlin; ISBN: 978-3-8396-1498-3
• Bruns, Volker; Eixelberger, Thomas; Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Mit allen Sinnen lernen: Auf dem Weg zur fehlerfreien Operation - Entwicklung eines virtuellen OP-Trainers zur Unterstützung von Chirurgen in der Neuro-, HNO- und MKG-Chirurgie (PDF) . 07/17/2019; Article; KU Gesundheitsmanagement; 17-20; Verband der Krankenhausdirektoren Deutschlands e.V.; ISSN: 0023-4508

• Franz, D.; Dreher, M.; Prinzen, M.; Teßmann, M.; Palm, C.; Katzky, U.; Perret, J.; Hofer, M.; Wittenberg, T.: CT-basiertes virtuelles Fräsen am Felsenbein: Bild- und haptischen Wiederholfrequenzen bei unterschiedlichen Rendering Methoden. 03/13/2018; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2018 : Algorithmen - Systeme - Anwendungen; 176-181; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_51
• Wittenberg, T.: Endoscopy. 03/13/2018; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2018: Algorithmen - Systeme - Anwendungen; S. 8; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_8
  
• Maier, J.; Huber, M.; Katzky, U.; Perret, J.; Wittenberg, T.; Palm, C.: Force-feedback-assisted bone drilling simulation based on CT data. 03/13/2018; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2018: Algorithmen - Systeme - Anwendungen; 291-296; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_78
• Unterer, B.; Wiesmann, V.; Gunasekaran, M.; Sticht, H.; Tenkerian, C.; Behrens, J.; Leone, M.; Engel, F.B.; Britzen-Laurent, N.; Naschberger, E.; Wittenberg, T.; Stürzl, M.: IFN-γ-response mediator GBP-1 represses human cell proliferation by inhibiting the Hippo signaling transcription factor TEAD. Article; Biochemical Journal 475, Nr. 18, 2955-2967; DOI: 10.1042/BCJ20180123
• Avenhaus, Malte; Benz, Michaela; Bergen, Tobias; Ernst, Andreas; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas; Zilly, Frederik: Image processing device and method for producing in real-time a digital composite image from a sequence of digital images of an interior of a hollow structure. 2018; Patent
• Bergler, Matthias; Weiherer, Maximilian (OTH Regensburg); Bergen, Tobias; Avenhaus, Malte; Rauber, David (OTH Regensburg); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Benz Michaela: Stitching pathological tissue images using DOP feature tracking. 3/5/2018;  Conference; Bildverarbeitung für die Medizin 2018. Proceedings des Workshops vom 11. bis 13. März 2018 in Erlangen; Informatik Aktuell; 322-327; Springer Vieweg;  DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_84

• Wittenberg, Thomas: Panorama und 3D Endoskopie; 4/1/2017; Lecture;  Munich; Germany
• Aichinger, W.; Krappe, S.; Cetin, A.E.; Cetin-Atalay, R.; Üner, A.; Benz, M.; Wittenberg, T.; Stamminger, M.; Münzenmayer, C.: Automated cancer stem cell recognition in H and E stained tissue using convolutional neural networks and color deconvolution.; 02/12/2017; Conference;  Proceedings; SPIE 10140, Medical Imaging 2017: Digital Pathology; DOI: 10.1117/12.2254036
  
• Krappe, Sebastian; Benz, Michaela; Gryanik, Alexander; Tannich, Egbert (Bernhard-Nocht Institut für Tropenmedizin (BNITM) Hamburg); Wegner, Christine (BNITM); Stamminger, Marc (Friedrich-Alexander-University Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Automated plasmodia recognition in microscopic images for diagnosis of malaria using convolutional neural networks. 2/11/2017; Conference; Proceedings; SPIE 10140, Medical Imaging 2017: Digital Pathology; DOI: 10.1117/12.2249845
• Kriegmair, M.C.; Bergen, T.; Ritter, M.; Mandel, P.; Michel, M.S.; Wittenberg, T.; Bolenz, C.: Digital Mapping of the Urinary Bladder: Potential for Standardized Cystoscopy Reports. 2017; Urology 104; 235-241; DOI: 10.1016/j.urology.2017.02.019
• Schulz-Wendtland, Rüdiger; Harz, Markus; Meier-Meitinger, Martina; Brehm, Barbara; Wacker, Till; Hahn, Horst; Wagner, Florian; Wittenberg, Thomas; Beckmann, Matthias; Uder, Michael; Fasching, Peter; Emons, Julius: Semi-automated delineation of breast cancer tumors and subsequent materialization using three-dimensional printing (rapid prototyping). 2017; Journal of surgical oncology 115; Vol. 3; 238-242; DOI: 10.1002/jso.24510
• Häberle, L.; Hack, C.C.; Heusinger, K.; Wagner, F.; Jud, S.M.; Uder, M.; Beckmann, M.W.; Schulz-Wendtland, R.; Wittenberg, T.; Fasching, P.A.: Using automated texture features to determine the probability for masking of a tumor on mammography, but not ultrasound. 2017; Arrticle; European journal of medical research 22; DOI: 10.1186/s40001-017-0270-0
• Wiesmann, Veit; Bergler, Matthias; Palmisano, Ralf (Univ. Erlangen); Prinzen, Martin; ranz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Using simulated fluorescence cell micrographs for the evaluation of cell image segmentation algorithms. 3/18/2017; Article; BMC Bioinformatics; DOI: 10.1186/s12859-017-1591-2
• Münzenmayer, Christian; Gryanik, Alexander; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas: Verfahren und Vorrichtung zum Erstellen einer Mikroskopiepanoramadarstellung. 2017; Patent
  
• Ott, L.; Hacker, E.; Kunert, T.; Karrington, I.; Etschel, P.; Lang, R.; Wiesmann, V.; Wittenberg, T.; Singh, A.; Varela, C.; Bhatt, A.; Sangal, V.; Burkovski, A.: Analysis of Corynebacterium diphtheriae macrophage interaction.; 2017; Article; PLoS one. Online journal 12; DOI: 10.1371/journal.pone.0180105

• Schulz-Wendtland, Rüdiger (University Hospital Erlangen); Harz, Markus (Fraunhofer MEVIS); Meier-Meitinger, Martina (University Hospital Erlangen); Brehm, Barbara (University Hospital Erlangen); Wacker, Till (FAU Erlangen); Hahn, Horst (Fraunhofer MEVIS); Wagner, Florian; Wittenberg, Thomas; Beckmann, Matthias (University Hospital Erlangen); Uder, Michael (University Hospital Erlangen); Fasching, Peter (University Hospital Erlangen); Emons, Julius (University Hospital Erlangen): Semi-Automated Delineation of Breast Cancer Tumors and Subsequent Materialization Using Three-Dimensional Printing (Rapid Prototyping). 12/14/2016; Article; Journal of Surgical Oncology; DOI: 10.1002/jso.24510
• Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: From OR-Planning to OR-Simulation for Cochlea Implants. 9/30/2016; Lecture; Bern, Switzerland
• Sandvoss, Jan; Wittenberg, Thomas; Nowack, Arne; Ernst, Jürgen: 3D-Reconstruction by Polarization Imaging in Endoscopy. 9/29/2016; Conference; 15. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2016); 53-57; Der Andere Verlag; ISBN: 978-3-86247-595-7
• Wittenberg, Thomas: Aktueller Stand Immersiver 3D-Technologien für die Medizin. 9/29/2016; Lecture; Bern, Switzerland
• Erpenbeck, Daniel; Wittenberg, Thomas; Rosenthal, Jean-Claude (Fraunhofer HHI); Kauff, Peter (Fraunhofer HHI); Lemke, Niels (Schölly Fiberoptic GmbH); Bergen, Tobias: Evaluierung von 3D-Rekonstruktionsverfahren in der Stereo-Laparoskopie. 9/29/2016; Conference; 15. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2016); 58-63; Der Andere Verlag; ISBN: 978-3-86247-595-7
• Franz, Daniela; Katzky, Uwe (szenaris GmbH); Neumann, Sabine (SeeFront GmbH); Peret, Jerome (Haption GmbH); Hofer, Mathias (HNO Klinik Leipzig); Huber, Michaela (UK Regensburg); Schmitt-Rüth, Stephanie; Haug, Sonja (OTH Regensburg); Weber, Karsten (OTH Regensburg); Prinzen, Martin; Palm, Christoph (OTH Regensburg); Wittenberg, Thomas: Haptisches Lernen für Cochlea Implantationen Konzept – HaptiVisT Projekt. 9/29/2016; Conference; 15. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2016); 21-26; Der Andere Verlag; ISBN: 978-3-86247-595-7
• Wittenberg, Thomas; Erpenbeck, Daniel, Brischwein, Matthias; Hagen; Eigl, Benjamin; Bergen, Tobias: Panoramaendoskopie – Von 2D zu 3D: Ein Update. 9/29/2016; Lecture; Bern, Switzerland
• Spinnler, Klaus; Bergen, Tobias; Sandvoss, Jan; Wittenberg, Thomas: Digital Image Processing for the Automation of NDT by Means of Endoscopy. 6/13/2016; Conference; Proceedings, 19th World Conference on Non-Destructive Testing (WCNDT 2016); 1168-1175; ISBN: 978-3-940283-78-8
• Krappe, Sebastian; Leisering, Richard; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Automatic Detection of Relevant Regions for the Morphological Analysis of Bone Marrow Slides. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016; Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuel; l272-276; Springer Vieweg; DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_48
• Erpenbeck, Daniel; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Tannich, Egbert (Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine (BNITM), Hamburg); Wegner, Christine (BNITM); Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Basic statistics of SIFT features for texture analysis. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016; Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuell; 98-103; Springer Vieweg; DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_19
• Wiesmann, Veit; Groß, Christine (Institute of Clinical and Molecular Virology, Erlangen); Franz, Daniela; Thoma-Kreß, Andrea K. (Institute of Clinical and Molecular Virology); Wittenberg, Thomas: Combining Active Contours and Active Shapes for Segmentation of Fluorescently Stained Cells. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016. Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuell; 122-127; Springer Vieweg; DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_23
• Dach, Claudia; Rau, Tilmann (Institute of Pathology, Bern); Geppert, Carol (Institute of Pathology, Erlangen); Hartmann, Alexander (Institute of Pathology, Erlangen); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Towards Computer-Assisted Diagnosis of Precursor Colorectal Lesions. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016. Algorithmen - Systeme - Anwendungen;  Informatik aktuell; 266-271; Springer Vieweg;  DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_47
• Kriegmair, Maximilian (UK Mannheim); Wittenberg, Thomas; Ritter, Manuel (UK Mannheim); Michel, Maurice (UK Mannheim); Bolenz, Christian (UK Ulm); Bergen, Tobias: Generating panoramic images of the urinary bladder for the digital documentation of cystoscopy findings using Endorama®: Development and first clinical experience. 3/1/2016; Article; European Urology Supplements; DOI: 10.1016/S1569-9056(16)60033-7
• Krappe, Sebastian; Wittenberg, Thomas; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Münzenmayer, Christian: Automated morphological analysis of bone marrow cells in microscopic images for diagnosis of leukemia: nucleus-plasma separation and cell classification using a hierarchical tree model of hematopoesis. 2/27/2016; Conference; Proceedings, SPIE 9785, Medical Imaging 2016: Computer-Aided Diagnosis; DOI: 10.1117/12.2216037
  
• Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas: Stitching and Surface Reconstruction from Endoscopic Image Sequences: A Review of Applications and Methods. 1/1/2016; Article; 304-321; IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics; DOI: 10.1109/JBHI.2014.2384134

• Franz, Daniela; Syré, Liane; Bischoff, Barbara (University Hospital Erlangen); Hastreiter, Peter (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas: Preoperative Planning of Neurovascular Compression Syndrome Surgery based on an Interactive Wizard-Based Segmentation Approach – Extended Evaluation Results. 9/17/2015; Conference; 14. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie e.V. (CURAC 2015); 195-200; ISBN: 978-3-00-050359-7
• Nowack, Sebastian; Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian; Raithel, Martin (Universitätsklinikum Erlangen); Prinzen, Martin; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Unterscheidung von Polypen und Hintergrundgewebe in statischen Koloskopieaufnahmen. 9/17/2015; Conference; 14. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie e.V. (CURAC 2015)
  201-204; ISBN: 978-3-00-050359-7
• Brischwein, Matthias; Wittenberg, Thomas; Bergen, Tobias: Image Based Reconstruction for Cystoscopy. 9/16/2015; Article; 470-474; De Gruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2015-0113
• Krappe, Sebastian; Sahin, Yesim; Bindl, Thomas; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: An interactive app for training and qualification in differentiating blood cells. 9/11/2015; Article; 361; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; De Gruyter Verlag
• Sonntag, Daniel (DKFI); Tresp, Volker (Siemens); Zillner, Sonja (Siemens); Cavallaro, Alexander (UK Erlangen); Hammon, Matthias (UK Erlangen); Reis, André (UK Erlangen); Fasching, Peter (UK Erlangen); Sedlmayr, Martin (UK Erlangen); Ganslandt, Thomas (UK Erlangen); Prokosch, Hans Ullrich (UK Erlangen); Budde, Klemens (Charité Berlin); Schmidt, Danilo (Charité Berlin); Hinrichs, Carl (Charité Berlin); Wittenberg, Thomas; Daumke, Philipp (Fa. Averbis); Oppelt, Philipp (IFG Erlangen): The Clinical Data Intelligence Project – A Smart Data Initiative. 8/1/2015; Article; Informatik-Spektrum; Springer Veerlag; DOI: 10.1007/s00287-015-0913-x
• Wittenberg, Thomas: Computergestützte Bildverarbeitung und Mustererkennung für die diagnostische und interventionelle Endoskopie. 4/24/2015; Lecture; Leipzig, Germany
• Wittenberg, Thomas: OP 2025 – Die Chirurgie von Morgen. 4/15/2015; Lecture; Tuttlingen, Germany
• Prinzen, Martin; Trost, Jonas; Bergen, Tobias; Nowack, Sebastian; Wittenberg, Thomas: 3D Shape Reconstruction of the Esophagus from Gastroscopic Video. 3/15/2015; CoConference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell;  173-178; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_31
• Krappe, Sebastian; Münzenmayer, Christian; Evert, Amrei; Fahrettin Koyuncu, Can (Bilkent University Ankara); Cetin, Enis (Bilkent University Ankara); Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Wittenberg, Thomas; Held, Christian: Dynamic Programming for the Segmentation of Bone Marrow Cells. 3/15/2015;  Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuell 2015; 359-36; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_62
• Prinzen, Martin ; Raithel, Martin (University Medical Center Erlangen); Bergen, Tobias; Mühldorfer, Steffen (Medical Center Bayreuth); Nowack, Sebastian; Wilhelm, Dirk (Technical University Munich); Wittenberg, Thomas: Panorama Mapping of the Esophagus from Gastroscopic Video. 3/15/2015; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell; 455-460; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_78
• Franz, Daniela; Hüttmayer, Hanna; Stamminger, Marc (University of Erlangen-Nuremberg); Wiesmann, Veit; Wittenberg, Thomas: The Cell-Shape-Wizard. User Guidance for Active Contour-based Cell Segmentation. 3/15/2015; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell; 341-346; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_59
• Franz, Daniela; Syré, Liane; Paulus, Dietrich (University of Koblenz and Landau); Bischoff, Barbara (University Hospital Erlangen), Wittenberg, Thomas; Hastreiter, Peter (University Hospital Erlangen): The SIP-NVC-Wizard. User Guidance on Segmentation for Surgical Intervention Planning of Neurovascular Compression. 3/15/2015; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell;  65-70; Springer Verlag;  DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_13
  
• Krappe, Sebastian; Evert, Amrei; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Held, Christian; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Smear detection for the automated image-based morphological analysis of bone marrow samples for leukemia diagnosis. 3/11/2015; Conference; Proceedings, Forum Life Science 2015
  
• Krappe, Sebastian; Benz, Michaela; Wittenberg, Thomas; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Münzenmayer, Christian: Automated classification of bone marrow cells in microscopic images for diagnosis of leukemia: A comparison of two classification schemes with respect to the segmentation quality. 2/21/2015; Conference; Proc. SPIE 9414, Medical Imaging 2015: Computer-Aided Diagnosis; DOI: 10.1117/12.2081946
  
  

• Struck, Matthias; Hofmann, Christian; Wittenberg, Thomas: Textile Bewegungserfassung und -parameter. 11/22/2014; Lecture; Erlangen, Germany
• Wiesmann, Veit; Franz, Daniela; Held, Christian; Münzenmayer, Christian; Palmisano, Ralf; Wittenberg, Thomas: Review of free software tools for image analysis of fluorescence cell micrographs. 11/1/2014; Article; Journal of Microscopy; DOI: 10.1111/jmi.12184
  
• Wittenberg, Thomas; Brischwein, Matthias; Nowack, Sebastian; Chen, Grace (The Johns Hopkins Medical School, Baltimore); Bergen, Tobias: Panoramabildgebung der Blase: Vom Phantom zu präklinischen Experimenten10/28/2014; Article; 146–150; Endoskopie Heute; DOI: 10.1055/s-0034-1385113
• Dach, Claudia; Erpenbeck, Daniel; Rademacher, Thomas (Fraunhofer IME); Reimann, Andreas (Fraunhofer IME); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Assessment of the plant health status based on hyperspectral and color image analysis towards the cGMP-compliant large-scale production of biopharmaceuticals in plants. 10/14/2014; Article; 563-566; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5008
• Franz, Daniela; Wiesmann, Veit; Stamminger, Marc (University Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas: Cell-Shape Wizard – A Concept for User-Guidance for Active Shape Segmentation in Fluorescence Cell Micrographs. 10/14/2014; Article; 877-880; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5011
• Erpenbeck, Daniel; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Development and evaluation of passive autofocus algorithms in the field of automated microscopy. 10/14/2014; Article; 559-562; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5008
• Wiesmann, Veit; Bergler, Matthias; Palmisano, Ralf (Optical Imaging Center Erlangen); Prinzen, Martin; Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Enhanced Fluorescent Cell Simulation using Texture Mapping and Statistical Shape Model. 10/14/2014; Article; 959-958; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5012
• Bergen, Tobias; Trost, Jonas; Wittenberg, Thomas: Entropy based image blending for endoscopic panorama imaging in cystoscopy1. 0/14/2014; Article; 595-598; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik
• Wittenberg, Thomas: Medizintechnik bei Fraunhofer: Eine Brücke zwischen Forschung und Industrie. 9/11/2014; Lecture; Munich, Germany
• Kuleschow, Andreas; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Optische Stabilisierung beim Laserabtrag in der handgeführten Kraniotomie. 9/11/2014; Conference; 13. CURAC Jahrestagung - Synergie durch Interdisziplinarität" (CURAC 2014)";
  135-139; ISBN: 978-3-00-047154-4
• Bergen, Tobias; Hastreiter, Peter (University Clinics, Erlangen); Xu, Tengfei (University Clinics, Erlangen); Münzenmayer, Christian; Buchfelder, Michael (University Clinics, Erlangen); Wittenberg, Thomas: Real-time panorama imaging of sphenoid sinuses from monocular endoscopic views: an update based on clinical experiments. 9/11/2014; Conference; CURAC 2014 - Synergie durch Interdisziplinarität; 32-35; ISBN: 978-3-00-047154-4
• Tepfenhart, Ronald; Prinzen, Martin; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas; Nowack, Sebastian: Scharf und Gut! – Vergleich von Qualitätsmaßen für die digitale Koloskopie. 9/11/2014; Conference; 13. CURAC Jahrestagung - Synergie durch Interdisziplinarität; 36-39; ISBN: 978-3-00-047154-4
• Wittenberg, Thomas: Endoskopie. 6/1/2014; Article;
  Biomedizinische Technik - Medizinische Bildgebung; Biomedizinische Technik; 455-470; De Gruyter Verlag, Berlin; DOI: 10.1515/9783110252149.455

• Kondruweit, Markus (Center of Cardiac Surgery, Erlangen); Friedl, Sven; Heim, Christian (Center of Cardiac Surgery); Wittenberg, Thomas; Weyand, Michael (Center of Cardiac Surgery); Harig, Frank (Center of Cardiac Surgery): A New Ex Vivo Beating Heart Model to Investigate the Application of Heart Valve Performance Tools with a High-Speed Camera. 1/1/2014; Article; 38–43; ASAIO Journal; DOI: 10.1097/MAT.0000000000000008

• Bergen, Tobias; Hastreiter, Peter (University Clinics Erlangen); Münzenmayer, Christian; Buchfelder, Michael (University Clinics Erlangen); Wittenberg, Thomas: Image stitching of sphenoid sinuses from monocular endoscopic views. 11/28/2013; Conference; Tagungsband, 12. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2013)
  226-229; Innsbruck, Austria
• Wittenberg, Thomas: Semi-automated wide field fluorescence microscopy image analysis. 9/26/2013;  Lecture; Erlangen, Germany
  
• Wiesmann, Veit; Sauer, Tobias; Held, Christian; Palmisano Ralph; Wittenberg, Thomas: Cell Simulation for Validation of Cell Micrograph Evaluation Algorithms. 9/22/2013; Conference, 47. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (BMT Jahrestagung); Biomedizinische Technik; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/bmt-2013-4272
• Dach, Claudia; Friedl, Sven; Vieth, Michael (Klinikum Bayreuth); Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian; Hartmann, Arndt (Universität Erlangen-Nürnberg); Geppert, Carol (Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: CAD4GERD - Computer-Assisted Diagnostic for Gastroesophageal Reflux Disease – First Results. 9/1/2013; Conference, 58. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS2013)
  547-548; German Medical Science GMS Publishing House, Düsseldorf; DOI: 10.3205/13gmds263
• Krappe, Sebastian; Efstathiou, Efthymios; Haferlach, Torsten (MLL Münchner Leukämielabor GmbH); Macijewski, Katja (MLL); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Training und Qualitätssicherung für die morphologische Analyse von Knochenmarkpräparaten. 9/1/2013; Conference; 58. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS2013); German Medical Science GMS Publishing House, Düsseldorf; DOI: 10.3205/13gmds246
• Bergen, Tobias; Nowack, Sebastian; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas: A hybrid tracking approach for endoscopic real-time panorama imaging. 6/26/2013; Article; 352-354
• Wittenberg, Thomas: »OP 2025« – Operationssäle von Morgen. 6/18/2013; Lecture; Erlangen, Gerermany
• Uter, Wolfgang (University of Erlangen-Nuremberg); Benz, Michaela; Mayr, Andreas (University of Erlangen-Nuremberg); Gefeller, Olaf (University of Erlangen-Nuremberg); Pfahlberg, Annette (University of Erlangen-Nuremberg): Assessing skin pigmentation in epidemiological studies: The reliability of measurements under different conditions. 5/1/2013; Article; 100-106; Skin Research and Technology; DOI: 10.1111/srt.12013
• Held, Christian; Wiesmann, Veit; Palmisano, Ralf (Optical Imaging Center, Erlangen); Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas: Interactive learning image analysis with application to fluorescence microscopy. 3/13/2013; Conference, Forum Life Science 2013
• Kage, Andreas; Muehldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Bergen, Tobias; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas: The importance of image quality assessment for the creation of reference image collection for computer-assisted diagnosis in colonoscopy. 1/26/2013; Article; 405-406;  DOI: 10.1007/s11548-013-0883-x
• Deserno, Thomas (RWTH Aachen); Handels, Heinz (Universtät Lübeck); Maier-Hein, Klaus (DKFZ Heidelberg); Mersmann, Sven (DKFZ Heidelberg); Palm, Christoph (HS Regensburg); Tolxdorff, Thomas (Charité Berlin); Wagenknecht, Gudrun (Forschungszentrum Jülich); Wittenberg, Thomas: Viewpoints on Medical Image Processing: From Science to Applications. 1/13/2013; Article; 79-88; Current Medical Imaging Reviews; DOI: 10.2174/1573405611309020002

• Weber, Norbert; Benz, Michaela; Ernst, Jürgen; Junger, Stephan; Neubauer, Harald: Polarisationskamera mit nanostrukturierten Bildsensoren macht Unsichtbares sichtbar. 12/1/2012; Article; S. 2728 - 2737; PLUS (Produktion von Leiterplatten Und Systemen) - Fachzeitschrift für Aufbau- und Verbindungstechnik in der Elektronik
• Weber, Norbert; Benz, Michaela; Ernst, Jürgen; Junger, Stephan; Neubauer, Harald: Polka öffnet den Blick ins Innere von Werkstoffen. 10/1/2012; Article; S. 32; Quality Engineering
• Mehlhorn, Grit (University Hospital Erlangen); Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela; Kage, Andreas; Beckmann, Matthias W. (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas: Computer-Assisted Diagnosis in Colposcopy: Results of a Preliminary Experiment? 9/27/2012; Artikel; 5. 54 – 559; Acta Cytologica; DOI: 10.1159/000341546
• Friedl, Sven; Geppert, Carol (Universitätsklinikum Erlangen); Hartmann, Arndt (Universitätsklinikum Erlangen); Paulsen, Friedrich (Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: A flexible virtual whole slide microscopy framework for distributed research. 9/16/2012; Conference; Proceedings, GMDS 2012: 57. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e. V. (GMDS); S. 279; Schattauer, Stuttgart; DOI: 10.3205/12gmds074
• König, Stefan; Kondruweit, Markus (Universitätsklinikum Erlangen); Weyand, Michael (Universitätsklinikum Erlangen); Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven: Detection and compensation of relative motion in endoscopic heart valve recordings by circular Hough transform. 9/16/2012; Conference; Proceedings, 57. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e.V. ; S. 242 - 243; Schattauer, Stuttgart
• Wiesmann, Veit; Held, Christian; Palmisano, Ralf (University Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas: Segmentation of HeLa cells in phase-contrast images with and without DAPI stained cell nuclei. 9/1/2012; Article; S. 519 - 522; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering
• Held, Christian; Wiesmann, Veit; Lengenfelder, Doris (University Erlangen-Nuremberg); Full, Florian (University Erlangen-Nuremberg); Palmisano, Ralf (University Erlangen-Nuremberg); Ensser, Armin (University Erlangen-Nuremberg), Wittenberg, Thomas: Automated high throughput image analysis of the ND10 complex of KSHV cells.8/31/2012; Article; S. 452 - 455; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering; DOI: 10.1515/bmt-2012-4049
• Friedl, Sven; Herdt, Eugen; Kondruweit, Markus (University Hospital Erlangen), Wittenberg, Thomas: Natural landmark tracking using triangle-based optical flow. 8/31/2012; Article; S. 695 - 697; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering
• Wittenberg, Thomas; Wagner, Florian; Gryanik, Alexander: Towards a Computer Assisted Diagnosis System for Digital Breast Tomosynthesis. 8/31/2012; Article; S. 223 - 226; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering
• Wittenberg, Thomas: Medizintechnik – Eine interdisziplinäre Herausforderung. 6/13/2012; Lecture; Munich, Germany
• Wittenberg, Thomas: Koloskopie : Technologien zur Endoskopischen Diagnostik und zukünftige Möglichkeiten. 6/12/2012; Lecture; Munich, Germany
  
• Friedl, Sven; Oehmke, Gregor (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas; Paulsen, Friedrich (University of Erlangen-Nürnberg); Hartmann, Arndt (University Hospital Erlangen); Geppert, Carol (University Hospital Erlangen): A web-based virtual microscopy platform as supplement for histopathology lectures. 5/31/2012; Conference; Tagungsband der Pathologie, 96. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie e.V.; S. 170; Springer Verlag
• Dach, Claudia; Geppert, Carol (University Erlangen), Friedl, Sven; Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian; Hartmann, Arndt (University Erlangen); Vieth, Michael (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Computer-assisted histology for the diagnosis of Barrett’s Esophagus – a pilot study. 5/31/2012; Conference; Tagungsband der Pathologie, 96. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie e.V.;
  S. 171 - 172; Springer Verlag
• Faschingbauer, Florian (Univ. Frauenklinik Erlangen); Beckmann, Matthias W. (Univ. Frauenklinik Erlangen); Weyert Goecke, Tamme (Univ. Fraunklinik Erlangen); Renner, Stefan (Univ. Frauenklinik Erlangen); Häberle, Lothar (Univ. Frauenklinik Erlangen); Benz, Michaela; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Automatic Texture-Based Analysis in Ultrasound Imaging of Ovarian Masses. 5/23/2012; Article; Epub ahead of print; Ultraschall in der Medizin; Georg Thieme Verlag KG; DOI: 10.1055/s-0031-1299331
• Dach, Claudia; Friedl, Sven; Geppert, Carol (Universität Erlangen); Gerlach, Sophia; Benz, Michaela; Hartmann, Arndt (Universität Erlangen); Münzenmayer, Christian; Vieth, Michael (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Computer-Assistierte Histologie für die Diagnose von Barrett-Ösophagus – Eine Pilotstudie. 3/22/2012; Conference; Endoskopie Heute, Tagungsband, 42. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Endoskopie und Bildgebende Verfahren e.V.; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0032-1308777
• Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Ernst, Andreas: Gestenbasierte Interaktion zwischen Mensch und Maschine zur Segmentierung endoskopischer Bilder. 3/22/2012; Conference; Endoskopie Heute, Tagungsband, 42. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Endoskopie und Bildgebende Verfahren e.V.; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0032-1308723
• Friedl, Sven; Herdt, Eugen; König, Stefan; Weyand, Michael; Kondruweit, Markus; Wittenberg, Thomas: Determination of Heart Valve Fluttering by Analyzing Pixel Frequency. 3/18/2012; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin 2012 - Algorithmen - Systeme - AnwendungenInformatik aktuell; S. 87 - 91; Springer Verlag, Berlin, Heidelberg
• Kage, Andreas; Legal, Wolfgang; Kelm, Peter; Simon, Jörg; Bergen, Tobias; Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Automatic Segmentation of lesions for the Computer-Assisted detection in fluorescence urology. 2/4/2012Conference; Proceedings, Medical Imaging 2012: Computer-Aided Diagnosis; DOI: 10.1117/12.911366
• Faschingbauer, Florian (UK Erlangen); Benz, Michaela; Häberl, Lothar (UK Erlangen) L, Goecke, Tamme (UK Erlangen); Beckmann, Matthias (UK Erlangen); Renner Stefan (UK Erlangen); Müller, Andreas (UK Erlangen), Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Subjective assessment of ovarian masses using pattern recognition: the impact of experience on diagnostic performance and interobserver variability. 1/20/2012; Article; 1663-9; Archives of Gynecology and Obstetrics; Springer Verlag; DOI: 10.1007/s00404-012-2229-2
• Gryanik, Alexander; Wittenberg, Thomas; Walles, Heike (Fraunhofer ISC), Steckhan, Dirk; Thude, Sybille (Fraunhofer ISC); Kaufmann, Michaela (Fraunhofer ISC); Münzenmayer, Christian: Automatic Image Quantification for Structural Analysis of in vitro Dermal Samples. 1/17/2012; Article; 494 - 497; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering; Walther deGruyter Verlag
  
• Münzenmayer, Christian; Schlarb, Timo; Steckhan, Dirk; Haßlmeyer, Erik; Bergen, Tobias; Aschenbrenner, Stefan; Wittenberg, Thomas; Weigand, Christian; Zerfaß, ThorstenHema: CAM® - A Computer Assisted Microscopy System for Hematology. 1/1/2012;
  Microelectronic Systems - Circuits, Systems and Applications
  227 - 235; Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg
  
• Wittenberg, Thomas; Fuchs, Theobald: Visual Computing at the IIS: From Life Sciences to Industrial Applications. 1/1/2012;
  Microelectronic Systems - Circuits, Systems and Applications
  221 - 226; Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg; DOI: 10.1007/978-3-642-23071-4_21
  

• Schlötelburg, Cord (DGBMT); Feußner, Hubertus (TU München); Meining, Alexander (TU München); Meyer; Jörg-Uwe (Fa. MT2IT); Melzer, Andreas (Univ. Dundee); Wittenberg, Thomas: Chancen und Limitierungen von Closed-Loop-Systemen im OP. 12/21/2011; Article; 278–281; Endoskopie Heute; DOI: 10.1055/s-0031-1283809
• Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Computer-integrierte Endoskopie. 12/21/2011; Article; 271–277; Endoskopie heute; DOI: 10.1055/s-0031-1283834
• Wittenberg, Thomas: Endoskopie heute - Editorial. 12/21/2011; Article; 246 - 247; Endoskopie heute; DOI: 10.1055/s-0031-1283871
• Gryanik, Alexander; Wagner, Florian; Schulz-Wendtland, Ruediger (University of Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas: Comparison of Manual and Automated Lesion Segmentation of Digital Breast Tomosynthesis Data – First Experiments. 10/11/2011; Conference; Proceedings, 7th Russian Bavarian Conference on Biomedical Engineering (RBC 2011); 191 - 196; Erlangen, Germany
• Kage, Andreas; Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian: Computer Assisted Surgery in Fluorescence Endoscopy. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston; Freiburg, Germany
• Efstathiou, Efthymios; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Winter, Christian; Bergen,Tobias: Evaluation of 3D Ultrasound Registration. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston; Freiburg, Germany
• Dach, Claudia; Held, Christian; Palmisano, Ralf; Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven: Evaluation of input modalities for the interactive image segmentation of fluorescent micrographs. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston; Freiburg, Germany
• Bergen, Tobias; Winter, Christian; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Three dimensional Doppler ultrasound for liver surgery navigation. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston Freiburg, Germany
  
• Dach, Claudia; Held, Christian; Wenzel, J (Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg); Lang, R (Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg); Friedl, Sven; Palmisano, Ralf (Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: Evaluierung der interaktiven Zellsegmentierung mit Hilfe des Graph Cuts Algorithmus in Fluoreszenz-Mikroskop-Bildern. 9/26/2011; Conference; Abstractband, 56. GMDS-Jahrestagung und 6. DGEpi-Jahrestagung,
  510-511; Mainz, Germany
• Friedl, Sven; Oehmke, Gregor; Wittenberg, Thomas; Hartmann, Arndt; Geppert, Carol: Freies Mikroskopieren im Web. 9/26/2011; Conference; Abstractband, 56. GMDS-Jahrestagung und 6. DGEpi-Jahrestagung; 177-178; Mainz, Germany
• Wenzel, Jens (University Hospital Erlangen); Held, Christian; Palmisano, Ralf (Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg); Teufel, Stefan (University Hospital Erlangen); David, Jean-Pierre (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas; Lang, Roland (University Hospital Erlangen): Measurement of TLR-induced macrophage spreading by automated image analysis: differential role of Myd88 and MAPK in early and late responses. 9/21/2011; Article; Frontiers in physiology2 (2011), Article 71; DOI: 10.3389/fphys.2011.00071
• Efstathiou, Efthymios; Deserno, Thomas ( RWTH Aachen); Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas; Bergen, Tobias: Evaluation of 3D Ultrasound Image Registration. 9/15/2011; Conference; Proceedings, 10. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC)
  17 - 20; Verlag Univ. Magdeburg; Magdeburg, Germany
• Kuleschow, Andreas; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: KLT Tracking zur schnellen Bewegungskorrektur auf Knochenoberflächen. 9/15/2011; Conference; Proceedings, 10. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC)
  53 - 56; Verlag Univ. Magdeburg; Magdeburg, Germany
• Friedl, Sven (University Hospital Erlangen); Morgus, Boris; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas; Bergen, Tobias: Landmark-based Feature Tracking for Endoscopic Motion Analysis. 9/15/20112011; Conference; Proceedings, 10. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC); 57-60; Verlag Univ. Magdeburg; Magdeburg, Germany
• Dach, Claudia; Held, Christian; Wenzel, Jens (Universität Erlangen-Nürnberg); Gerlach, Sophia; Lang, Roland (Universität Erlangen-Nürnberg); Palmisano, Ralf (Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: Evaluation of an interactive cell segmentation for fluorescence-microscopy based on the Graph Cut algorithm. 9/2/2011; Conference; Proceedings, 7th Workshop Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB 2011); Heidelberg, Germany
• Held, Christian; Wenzel, Jens (Univ. Erlangen); Webel, Rike (Univ. Erlangen); Marschall, Manfred (Univ. Erlangen); Lang, Roland (Univ. Erlangen); Palmisano, Ralf (Univ. Erlangen); Wittenberg, Thomas: Using Multimodal Information for the Segmentation of Fluorescent Micrographs with Application to Virology and Microbiology. 8/30/2011; Conference; Proceedings, 33rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS 2011); DOI: 10.1109/IEMBS.2011.6091601
• Wittenberg,Thomas; Kage, Andreas; Benz, Michaela; Winter, Christian; Koch, Martin (Universitätsklinik Erlangen); Beckmann, Matthias (Universitätsklinik Erlangen); Münzenmayer, Christian; Mehlhorn, Grit (Universitätsklinik Erlangen): GynCAD: Computer-Assisted Diagnosis for Colposcopy. 6/24/2011; Lecture; Berlin, Germany
  
• Friedl, Sven; Drechsler, Klaus (Fraunhofer IGD); Oyarzun, Laura Christina (Fraunhofer IGD); Kuleschow, Andreas; Kondruweit, Markus (University Hospital, Erlangen); Wittenberg, Thomas: A holistic approach using multimodal image-data for the support of cardiac surgery interventions.6/22/2011; Conference; Proceedings, 25th International Congress and Exhibition on Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS '11); 235 - 238; Springer Verlag; Berlin, Germany
• Bergen, Tobias; Efstathiou, Efthymios; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Winter, Christian: Geometric calibration of 3D ultrasound with a tracking system for volume stitching. 6/22/2011; Conference; Proceedings, 25th International Congress and Exhibition on Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS '11); 258 - 260; Springer Verlag; Berlin, Germany
• Ihlow, Alexander (Ilmenau University of Technology); Arndt, Daniel (Ilmenau University of Technology); Topf, Felix (Ilmenau University of Technology); Rothaug, Christoph (Ilmenau University of Technology); Wittenberg, Thomas; Heuberger, Albert (Ilmenau University of Technology): Photogrammetric Satellite Service Prediction – Correlation of RF Measurements and Image Data. 6/8/2011; Conference; Proceedings, IEEE International Symposium on Broadband Multimedia Systems and Broadcasting (BMSB 2011); S. 26; DOI: 10.1109/BMSB.2011.5954884
• Wittenberg, Thomas; Held, Christian; Dach, Claudia; Palmisano, Ralf: Automated and Interactive Learning Image Analysis for Fluorescent Micrographs. 4/12/2011; Lecture; Erlangen, Germany
• Friedl, Sven; König, Stefan; Kondruweit, Markus; Wittenberg, Thomas: Digital Kymography for the Analysis of the Opening and Closure Intervals of Heart Valves. 3/20/2011; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2011Informatik aktuell; 144 - 148; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_31
• Ihlow, Alexander (Ilmenau University of Technology); Held, Christian; Rothaug, Christoph (Ilmenau University of Technology); Dach, Claudia; Wittenberg, Thomas; Steckhan, Dirk: Evaluation of Expectation Maximization for the Segmentation of Cervical Cell Nuclei. 3/20/2011; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2011; Informatik aktuell; 139 - 143; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_30
• Held, Christian; Wenzel, Jens (Inst. für Immunologie u. Hygiene, Uni Erlangen); Ralf, Palmisano (Inst. für Immunologie u. Hygiene, Uni Erlangen); Lang, Roland (Inst. für Immunologie u. Hygiene, Uni Erlangen); Wittenberg, Thomas: Segmentierung von Makrophagen in Fluoreszenzbildern mittels Fast Marching Level Set Verfahren. 3/20/2011; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2011; Informatik aktuell; 129 - 133; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_28
• Wittenberg, Thomas; Dach, Claudia; Friedl, Sven; Kage, Andreas; Winter, Christian; Münzenmayer, Christian: Barrett's Esophagus – No end of the »Hurley–Burley« - Image processing : A way out of the Dilemma? 3/18/2011; Lecture; Munich, Germany
• Benz, Michaela; Rojas-Solano, Jose (Thoraxklinik Heidelberg); Kage, Andreas; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Becker, Heinrich D. (Thoraxklinik Heidelberg): Computer-assistierte Diagnostik für die Bronchoskopie. 3/17/2011; Conference; Endoskopie heute - Forum bildgebender Verfahren; Proceedings, 41. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Endoskopie und Bildgebende Verfahren e.V.; S. 79; Georg Thieme Verlag KG, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1275383
• Wittenberg, Thomas; Benz, Michaela; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian: Computer-unterstützte Diagnostik - Computer-assisted Diagnosis. 3/17/2011; Lecture; Munic, Germany
• Münzenmayer, Christian; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Engelhardt Lisa; Benz, Michaela; Wittenberg, Thomas: Bildbasierte Unterscheidung kolorektaler Polypen und Hintergrundgewebe mittels Farbtexturanalyse. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S. 60; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271225
• Wittenberg, Thomas; Stallkamp, Jan (Fraunhofer IPA): Closed-loop Surgery. 3/16/2011; Lecture; Munich, Germany
• Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Computational Endoscopy or 50 Years of unused Information in Endoscopy. 3/16/2011; Lecture; Munich, Germany
• Mehlhorn, Grit (Frauenklinik Erlangen); Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela; Kage, Andreas; Koch, Martin (Frauenklinik Erlangen); Beckmann Matthias (Frauenklinik Erlangen); Wittenberg,Thomas: Computer-assistierte Diagnostik (CAD) für die Kolposkopie: Unterscheidung von Low-Grade, High-Grade und Tumor-Läsionen der Cervix uteri. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S.
  59; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271222
• Bergen, Tobias; Schneider, Armin (Klinikum r.d. Isar, München); Münzenmayer, Christian; Knödgen, Fritz (Klinikum r.d. Isar, München); Feussner, Hubertus (Klinikum r.d. Isar, München); Winter, Christian; Wittenberg, Thomas: Echtzeit-Stitching endoskopischer Bilder für eine erweiterte Sicht in chirurgischen Eingriffen. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S. 62; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271227
• Stallkamp, Jan (Fraunhofer IPA); Drechsler, Klaus (Fraunhofer IGD); Bergen, Tobias; Kaltenbacher, Dominik (Fraunhofer IPA); Burisch, Michael (Fraunhofer IGD); Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Sakas, Georgios (Fraunhofer IGD); Werner, Norman (Fraunhofer IPA); Wechsler, Axel (Fraunhofer IPA); Winter, Christian; Wittenberg, Thomas: Ein neues Konzept eines Integrierten Assistenzsystems für die navigierte Weichteilchirurgie. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S. 62; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271231
• Wittenberg, Thomas: Visual Computing in der medizinischen Diagnose und Therapie. 1/24/2011; Lecture; Coburg, Germany
  
  
  
  
  
  
  
  

• Mehlhorn, Grit (Frauenklinik der Universität Erlangen); Münzenmayer, Christian; Kage, Andreas; Benz, Michaela; Koch, Martin (Frauenklinik der Universität Erlangen); Winter, Christian; Beckmann, Matthias (Frauenklinik der Universität Erlangen); Wittenberg, Thomas: Computer-assistierte Diagnostik (CAD) für die Kolposkopie – Evaluation einer Pilotstudie. 12/22/2010; Article; S. 290 - 296; Endoskopie Heute; 2010, 23(4); DOI: 10.1055/s-0030-1262651
• Wittenberg, Thomas: Future of Medical Technologies for Endoscopy-based Interventions – Possible Influences from Applied Research. 11/19/2010; Lecture; Düsseldorf, Germany
• Benz, Michaela; Rojas-Solano, Jose R. (Thoraxklinik at Heidelberg University); Kage, Andreas; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Becker, Heinrich D. (Thoraxklinik at Heidelberg University): Computer-Assisted Diagnosis for White Light Bronchoscopy: First Results. 10/29/2010; Conference; Table of Contents, Chest 2010; Vol. 138 no. 4 supp 433A; DOI: 10.1378/chest.10959
• Stallkamp, Jan (Fraunhofer IPA); Drechsler, Klaus (Fraunhofer IGD); Bergen, Tobias; Kaltenbacher, Dominik (Fraunhofer IPA); Burisch, Michael (Fraunhofer IGD); Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Sakas, Georgios (Fraunhofer IGD); Werner, Norman (Fraunhofer IPA); Wechsler, Axel (Fraunhofer IPA); Winter, Christian; Wittenberg, Thomas: Whole’O’Hand – A holistic intervention and interaction system: A novel concept for closed-loop liver surgery. 10/6/2010; Article; S. 27 - 31; Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering; Proceedings, BMT 2010, 44. DGBMT Jahrestagung, 3-Länder-Tagung D-A-CH, Rostock; 55 (Suppl.1 ), 2010; DOI 10.1515/BMT.2010.264
• Höller Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Schneider, Armin (Technical University, Munich); Jahn, Jasper; Guttierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Endoscopic Image Rectification using Gravity. 6/23/2010; Conference; International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery; S.
  247 - 248; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; Volume 5 / Suppl. 1; ISSN: 1861-6410; Geneva, Switzerland
• Arndt, Igor; Ernst, Andreas; Friedl, Sven; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Küblbeck, Christian; Wittenberg, Thomas: Gesture Based Segmentation of Medical Imagery for Sterile Environments: A new approach. 6/23/2010; Confernce; International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery; S. 407 - 409; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; Volume 5 / Suppl. 1; ISSN: 1861-6410; Geneva, Switzerland
  
• Tantinger, Daniel; Krassnig, Gerd; Weigand, Christian; Wittenberg, Thomas; Hofmann, Christian; Struck, Matthias: Automatische Erkennung und Klassifikation von Körperhaltungen und Aktivitäten. 5/19/2010; Conference; Kooperationsforum Intelligente Objekte und Mobile Informationssysteme im Gesundheitswesen; DOI: 10.3205/10iis04
• Krassnig, Gerd; Tantinger, Daniel; Hofmann, Christian ; Wittenberg, Thomas; Struck, Matthias: User-friendly system for recognition of activities with an accelerometer. 3/22/20102; Conference; Proc's 4th IEEE Int. Conf. on Pervasive Computing Technologies for Healthcare 'Pervasive Health 2010'; DOI: 10.4108/ICST.PERVASIVEHEALTH2010.8853
  
• Wittenberg, Thomas; Kage, Andras; Münzenmayer, Christian: CAD, Colposcopy and a little quiz… 3/20/2010; Lecture; Erlangen, Germany
  
• Barthold, Christine; Papst, Anton; Wittenberg, Thomas; Küblbeck, Christian; Lautenbacher, Stefan (Universität Bamberg); Schmid, Ute (Universität Bamberg); Friedl, Sven: Tracking von Gesichtsmimik mit Hilfe von Gitterstrukturen zur Klassifikation von schmerzrelevanten Action Units. 3/14/2010; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2010 - Algorithmen, Systeme, Anwendungen (BMV 2010); Informatik aktuell; S. 455 - 459; SpringerBerlin, Heidelberg, New York; ISBN: 978-3-642-11967-5
  
• Mehlhorn, Grit (UKER); Münzenmayer, Christian; Kage, Andreas ; Benz, Michaela; Koch, Martin (UKER); Wittenberg, Thomas; Beckmann, Matthias (UKER): Evaluation einer Computer-assistierten Diagnostik (CAD) für die Kolposkopie - Daten einer Pilotstudie. 3/1/2010; Article; P. 204; Z.\ für Onkologie; Vol. 23, Suppl. 2; ISBN: 978-3-8055-9439-4
• Kondruweit, Markus (Herzchirurgische Klinik, Erlangen); Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven; Tandler, Rene (Herzchirurgische Klinik, Erlangen); Weyand, Michael (Herzchirurgische Klinik, Erlangen): Description of a novel ex-vivo imaging and investigation technique to record, analyze and visualize heart valve motion under physiological conditions. 2/14/2010; Lecture; Stuttgart, Germany
  
• Wagner, Florian; Wittenberg, Thomas; Elter, Matthias: Classification of Mammographic Masses – Influence of Regions Used for Feature Extraction on the Classication Performance. 2/12/2010; Conference Proceedings, Medical Imaging 2010: Computer Aided Diagnosis; Vol. 7624; DOI: 10.1117/12.844675

• Wittenberg, Thomas: HemaCAM® – Computer-assistierte Mikroskopie für die Hämatologie -- Von der Idee bis zum System – Ein Rückblick. 11/20/2009; Lecture; Düsseldorf, Germany
• Friedl, Sven; Wittenberg, Thomas: MISS – ein konzeptioneller geschlossener Kreislauf für die minimal-invasive Herz-Chirurgie. 11/18/2009; Lecture; Düsseldorf, Germany
• Jahn, Jasper; Gutierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Schneider, Armin (Technical University Munich); Gillen, Sonja (Technical University Munich); Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Höller, Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Penne, Jochen (University Erlangen-Nuremberg); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Endoscopic Orientation Correction. 9/20/2009; Conference Proceedings, 12th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2009); London, UK; DOI: 10.1007/978-3-642-04268-3_57
• Jahn, Jasper; Gutierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Schneider, Armin (Technical University Munich); Gillen, Sonja (Technical University Munich); Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Höller, Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Penne, Jochen (University Erlangen-Nuremberg); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Clinical Evaluation of Endorientation: Gravity related rectification for endoscopic images. 9/16/2009; Conference; Konferenz IEEE Symposium 2009; Salzburg, Austria
  
• Rulsch, Martin; Benz, Michaela; Arzt, Christian; Podolak, Christian; Zhong, Jinghua; Couronné, Robert: A lightweight approach for activity classification on microcontrollers. 9/7/2009; Conference Proceedings, 11th International Congress of the IUPESM Medical Physics and Biomedical Engineering, World Congress 2009; Munich, Germany; DOI: 10.1007/978-3-642-03889-1_51
• Friedl, Sven; Wittenberg, Thomas; Kondruweit, Markus: Interactive Registration and Visualization of Cardiac Video and Angiography. 9/7/2009; Conference; Tagungsband IFMBE Proceedings WC 2009; S. 468 - 471; Springer Verlag, Heidelberg; 25/IV; DOI: 10.1007/978-3-642-03882-2-124
• Wittenberg, Thomas; Drechler, Klaus (Fraunhofer IGD); Kaltenbacher, Dominik (Fraunhofer IPA); Friedl, Sven; Rotinat-Libersa, Christine (CEA-LIST Paris); Reis, Christian (Fraunhofer IPA); DiBetta Marie (Fraunhofer IGD); Sakas, Georg (Fraunhofer IGD); Perrot, Yann (CEA LIST, Paris);Stallkamp, Jan ( Fraunhofer IPA); Kondruweit, Markus (Universitätsklinik, Erlangen): MISS Heart: Assisting Systems for Minimal Invasive Smart Suturing in Cardiac Surgery – A Conceptually Closed-Loop Approach. 9/7/2009; Conference; Tagungsband Proc's World Congress on Medical Physics \& Biomedical Engineering 2009 IFMBE Proceedings; S. 445-448; Springer Verlag, Heidelberg; 25/IV; ISBN: 978-3-642-03897-6
• Jahn, Jasper; Gutierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Schneider, Armin (Technical University Munich); Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Höller, Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Penne, Jochen (University Erlangen-Nuremberg); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Suppression of shock based errors with gravity related endoscopic image rectification. 7/29/2009; Conference Proceedings, Cardinal Health Retail Business Conference (RBC 2009); Washington D. C., USA
• Wittenberg, Thomas: Introduction to automated and interactive learning image-analysis for fluorescence-microscopy by the example of microbial effectors in host cells. 6/23/2009; Lecture; Erlangen, Germany
• Münzenmayer, Christian; Shevchenko, Nikita; Wittenberg, Thomas; Mühldorfer, Steffen: Sum- and difference-histogram Features versus Color and Position for Automated Polyp Recognition. 6/23/2009; Lecture; Berlin, Germany
• Wittenberg, Thomas: Computer based imaging analysis for endoscopic surgery. 6/17/2009; Lecture; Prague, Czech Republic
• Heidt, Sven-René von der (University of Koblenz); Elter, Matthias; Wittenberg, Thomas; Dietrich Paulus (University of Koblenz): Model-based characterization of mammographic masses. 3/22/2009; Conference Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2009 – Algorithmen, Systeme, Anwendungen; Informatik Aktuell; S. 287 - 291; Springer Verlag; Heidelberg, Berlin, New York; DOI: 10.1007/978-3-540-93860-6_58
• Elter, Matthias; Wittenberg, Thomas; Schulz-Wendtland, Rüdiger (University of Erlangen-Nürnberg); Deserno, Thomas M. (RWTH Aachen University): A multi-image approach to CADx of breast cancer with integration into PACS. 2/7/20092009; Conference; SPIE Medical Imaging 2009: Advanced PACS-based Imaging Informatics and Therapeutic Applications, Proceedings of SPIE 2009; Proceedings of SPIE; No. 7264-32; Vol. 7264; DOI: 10.1117/12.810983
• Kage, Andreas; Raithel, Martin (University of Erlangen-Nürnberg); Zopf, Steffen (University of Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Narrow-Band Imaging for the Computer-Assisted Diagnosis in Patients with Barrett’s Esophagus. 2/7/2009; Conference; Medical Imaging 2009: Computer-Aided Diagnosis, Proceedings of SPIE Medical Imaging 2009; Proceedings of SPIE; No. 7260-138; Vol. 7260; DOI: 10.1117/12.812257
  

• Mennicke, Jörg (Univ. Bamberg); Münzenmayer, Christian; Wittenberg,Thomas; Schmid, Ute ( University of Bamberg): An optimization framework for classifier learning from image data for computer-assisted diagnosis. 11/23/2008; Conference Proceedings, 4th European Congress for Medical & Biological Engineering (eMBEC 2008) Engineering for Health IFMBE Proceeding; s 629 – 632; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; Vol. 22; ISBN 978-3-540-89207-6; DOI: 10.1007/978-3-540-89208-3_150
  
• Wittenberg, Thomas; Becher, Florian Becher; Hensel Michael (Univ. Erlangen); Steckhan, Dirk: Image segmentation of cell nuclei based on classification in the color space. 11/23/2008; Conference Proceedings, 4th European Congress for Medical & Biological Engineering (eMBEC 2008) Engineering for Health IFMBE Proceeding; s 613 – 614; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; ISBN 978-3-540-89207-6
• Steckhan, Dirk; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Rupp, Stephan: Robust image stitching for virtual microscopy. 8/20/2008; Conference Proceedings, 30th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (IEEE EMBC 2008); Vancouver, Canada; DOI: 10.1117/12.812144
  
• Bergen, Tobias; Steckhan, Dirk; Wittenberg, Thomas; Zerfaß, Thorsten: Segmentation of leukocytes and erythrocytes in blood smear images. 8/20/2008; Conference Proceedings, 30th International Conference on the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC) 2008; Vancouver, Canada; DOI: 10.1109/IEMBS.2008.4649853
• Caulier, Yannick; Spinnler, Klaus; Wittenberg, Thomas; Bourennane, Salah (Université Aix-Marseille III): Segmentation and Classification of Anomalies in Periodic Structures. 7/1/2008; Article; Journal of Electronic Imaging; Vol. 17 (3); DOI: 10.1117/1.2954127
  
• Wittenberg, Thomas: A short history of common visions, goals and expectations. 6/18/2008; lecture; Baltimore, USA
  
• Caulier, Yannick; Spinnler, Klaus P.; Wittenberg, Thomas M.; Bourennane, Salah (Université Aix-Marseille III): Specific features for the analysis of fringe images. 5/1/2008; Article; Journal of Optical Engineering; Vol. 47 (05); DOI: 10.1117/1.2927463
• Weiß, Oliver; Friedl, Sven; Kondruweit, Markus (Universitätsklinik Erlangen); Wittenberg, Thomas: Aufnahme, Analyse und Visualisierung von Bewegungen nativer Herzklappen ex vivo. 4/6/2008; Conference; Konferenz Bildverarbeitung für die Medizin 2008; Informatik aktuell; S. 328 - 332; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; DOI: 10.1007/978-3-540-78640-5_66
• Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Kage, Andreas; Elter, Matthias: Challenges and Developments of Computer Assisted Diagnosis (CAD) – Herausforderungen und Entwicklungen der Computer Assistierten Diagnose (CAD). 2/27/2008; Lecture; Mannheim, Germany
  
• Zerfaß, Thorsten; Rehn, Thomas; Wittenberg, Thomas: Boundary precise segmentation of nucleus and plasma of leukocytes. 2/16/20082008KonferenzbeitragKonferenzProceedings, SPIE Medical Imaging 2008: Image Processing; Vol. 6914; DOI: 10.1117/12.770370
• Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian, Elter, Matthias: Computer-Assisted Diagnosis (CAD) and Cognitive Systems. 2/7/2008; Lecture; Bamberg, Germany
  
• Wittenberg, Thomas: Challenges and Developments of Computer Assisted Diagnosis. 1/1/2008; Lecture; Baltimore, USA
• Wittenberg, Thomas: Possible Puzzle-Pieces for the Fraunhofer-Carnot-Cooperation from Fraunhofer IIS. 1/1/2008; Lecture; Paris, France
• Wittenberg, Thomas; Kage, Andreas; Bergen, Tobias; Elter, Matthias; Münzenmayer, Christian: Computer-Assisted Diagnosis by Content-Based Image Retrieval – Clinical Use of Retrieval Systems and Databases. 1/1/2008; Lecture; Bamberg, Germany
• Wittenberg, Thomas; Berlage, Thomas (Fraunhofer FIT): Intelligente Bildverarbeitung für mikroskopische Anwendungen. 1/1/2008; Lecture; Berlin, Germany
• Caulier, Yannick; Spinnler, Klaus; Bourennane, Salah (Université Aix-Marseille III); Wittenberg, Thomas: New Structured Illumination Technique for the Inspection of High-Reflective Surfaces: Application for the Detection of Structural Defects without any Calibration Procedures.1/1/2008; Article; EURASIP Journal on Image and Video Processing; Vol. 2008 (2008); DOI: 10.1155/2008/237459