Medical Image Analysis – Our Publications and Downloads

Daniel Firmbach, Michaela Benz, Petr Kuritcyn, Volker Bruns, Corinna Lang-Schwarz, Frederik A. Stuebs, Susanne Merkel, Leah-Sophie Leikauf, Anna-Lea Braunschweig, Angelika Oldenburger, Laura Gloßner, Niklas Abele, Christine Eck, Christian Matek, Arndt Hartmann, Carol I. Geppert: Tumor–Stroma Ratio in Colorectal Cancer—Comparison between Human Estimation and Automated Assessment,  Cancers 2023, 15(10), 2675; https://doi.org/10.3390/cancers15102675 , PMID: 37345012

Thomas Eixelberger, Philip Maisch, Stephan Kruck, Sebastian Belle, Maximilian Kriegmair, Christian Bolenz, Thomas Wittenberg: Deep Learning by Domain Transfer for Early Tumor Detection in the Urinary Bladder, https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1014

Lukas Heinlein , Michaela Benz , Petr Kuritcyn , Volker Bruns , Arndt Hartmann , Felix Keil , Carol Geppert , Katja Evert und Thomas Wittenberg: Lymph node metastases detection in Whole Slide Images using prototypical patterns and transformer-guided multiple instance learning, Current Directions in Biomedical Engineering; https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1042

Ibrahim Ibrahim , Tobias Draeger und Thomas Wittenberg: Identification of Surgical Instruments Using a Low Frequency Magnetic Field, Current Directions in Biomedical Engineering; https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1015

Rosalie Kletzander, Petr Kuritcyn , Volker Bruns , Markus Eckstein , Carol Geppert , Arndt Hartmann und Michaela Benz: Domain Transfer in Histopathology using Multi-ProtoNets with Interactive Prototype Adaptation, Current Directions in Biomedical Engineering; https://doi.org/10.1515/cdbme-2023-1123

R. Kletzander1, M. Benz1, V. Bruns1, P. Kuritcyn1, D. Firmbach2, C. Matek2, C. I. Geppert2, A. Hartmann2, M. Eckstein: Interactive AI training with minimal annotations (page 138), Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie (DGP), 1.-3.6.2023; https://www.pathologie-dgp.de/media/Dgp/Jahrestagung-2022/DGPatho2023_Abstractband_final_Webversion.pdf

• F. Wilm, M. Benz, V. Bruns, S. Baghdadlian, J. Dexl, D. Hartmann, P. Kuritcyn, M. Weidenfeller, Th. Wittenberg, S. Merkel, A. Hartmann, M.  Eckstein, C. I. Geppert: "Fast whole-slide cartography in colon cancer histology using superpixels and CNN classification.” Journal of Medical Imaging, 9(2), 027501 (2022). https://doi.org/10.1117/1.JMI.9.2.027501, PMID: 35300344
  
• Th. Wittenberg, M. Benz, A. Foltyn, R. Hackner, J. Hetzel, V. Wiesmann und Th. Eixelberger: "Acquisition of Semantics for AI-based Applications in Medical Technologies." Current Directions in Biomedical Engineering 2021; 7(2); https://doi.org/10.1515/cdbme-2021-2131
  
• Volker Bruns, Michaela Benz, Carol Geppert: "Tissue Cartography for Colorectal Cancer."  Chapter 9: Artificial Intelligence Applications in Human Pathology, pp. 203-241 (2022); https://doi.org/10.1142/9781800611399_0009
• Jakob Dexl, Michaela Benz, Volker Bruns, Petr Kuritcyn, Thomas Wittenberg: "MitoDet: Simple and Robust Mitosis Detection." Conference Papaer; MICCAI 2021: Biomedical Image Registration, Domain Generalisation and Out-of-Distribution Analysis pp 53–57; DOI: 10.1007/978-3-030-97281-3_7
  
• Volker Bruns: "Digitale Transformation – Vom klassischen zum digitalen Pathologielabor". Sonderausgabe TDP 1/2022 Digitale Transformation
  
• Michaela Benz, Volker Bruns: "Parasiten mittels Webbrowser aufspüren." Management & Krankenhaus; Whitepaper
  
• R. Kletzander, D. Firmbach, V. Bruns, C. I. Geppert, A. Hartmann, M. Eckstein, M. Benz: "Few-Label Adaptation using Multi-ProtoNets – an Experiment on Urothelial Carcinomas." 18th European Congress on Digital Pathology (ECDP), Berlin, Germany, June 2022
  
• Bruns, V., Benz, M., Kuritcyn, P., Dexl, J., Wittenberg, T., Eckstein, M., Hartmann, A., Geppert, C., "Fast and Robust Deep Tissue Cartography for Colon Section." 105. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie (DGP), Münster, June 2022
• Eixelberger, T., Niedermair, T., Evert, K., Müller, B., Vermeulen, D., Steiger, K., Delbridge, C., Heimberg, W., Mayer, M., Schüffler, P., Weichert, W., Evert, M., Brochhausen-Delius, C., Bruns, V.: "Pre-Scan QC – Preliminary Results for Artefact Detection in Slide Overview Images." 105. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie (DGP), Münster, June 2022
• Thomas Eixelberger, Gabriel Wolkenstein, Ralf Hackner, Volker Bruns, Steffen Mühldorfer, Udo Geissler, Sebastian Belle, and Thomas Wittenberg: YOLO networks for polyp detection: A human-in-the-loop training approach." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
• Veronika Kress, Thomas Wittenberg, Martin Raithel, Volker Bruns, Edgar Lehmann, Thomas Eixelberger, and Ralf Hackner: "Automatic detection of foreign objects and contaminants in colonoscopic video data using deep leaning." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
• Jakob Dexl, Michaela Benz, Petr Kuritcyn, Thomas Wittenberg*, Volker Bruns, Carol Geppert, Arndt Hartmann, Bernd Bischl, and Jann Goschenhofer: "Robust Colon Tissue Cartography with Semi-Supervision." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
  
• Aliya Mohammed, Carol Geppert, Arndt Hartmann, Petr Kuritcyn, Volker Bruns, Ute Schmid, Thomas Wittenberg, Michaela Benz and Bettina Finzel: "Explaining and Evaluating Deep Tissue Classification by Visualizing Activations of Most Relevant Intermediate Layers." Joint Annual Conference of the Austrian, German and Swiss Societies for Biomedical Engineering, Sep 2022
• Egbert Tannich, Birgit Förster, Christine Wegner, Ulrike Loderstädt, Volker Bruns, Michaela Benz, Christian Hammer, Christopher Kussin: "ParasiteWeb^® – A Web Platform for Training and Quality Assessment in Parasite Microscopy Comprising a Comprehensive Digitized Sample Collection." Conference on Tropical Medicine and Global Health (CTM), Rostock, Germany, June 2022  

• S. Walluscheck, Th. Wittenberg, V. Bruns, Th. Eixelberger, R. Hackner: "Partial 3D-reconstruction of the colon from monoscopic colonoscopy videos using shape-from-motion and deep learning" Current Directions in Biomedical Engineering, vol. 7, no. 2, 2021, pp. 335-338. https://doi.org/10.1515/cdbme-2021-2085
• V. Bruns, D. Franz, P. Kuritcyn, V. Wiesmann, M. Rathke, Th. Wittenberg, A. Wießner, L. Kursawe, A. Moter, J. Kikhney, Ch. Münzenmayer:"Towards computer aided diagnosis of infective endocarditis in whole-slide images of heart valve tissue using FISH" Current Directions in Biomedical Engineering, vol. 7, no. 2, 2021, pp. 468-471. https://doi.org/10.1515/cdbme-2021-2119
• Ralf Hackner, Rodrigo Suarez-Ibarrola, Tian Qiu , Niels Lemke , Philipp-Fabian Pohlmann, Konrad Wilhelm , Peer Fischer, Arkadiusz Miernik, Thomas Wittenberg: Panoramic Imaging Assessment of Different Bladder Phantoms - An Evaluation Study. Urology, Oct. 2021,DOI: 10.1016/j.urology.2021.05.036, PMID: 34087314
  
• J. Deuschel, D. Firmbach, C.I. Geppert, M. Eckstein, A. Hartmann, V. Bruns, P. Kuritcyn, J. Dexl, D. Hartmann, D.Perrin, Th. Wittenberg, M. Benz: Multi-Prototype Few-Shot Learning in Histopathology. 2021; proceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV) Workshops; pp. 620-628
• Th. Wittenberg, A. Friedrich, A. Wittenberg, St. von Delius, M. Raithel, Th. Eixelberger, S. Nowack: Initial experiments of eye-tracking during AI-assisted polyp-detection in colonoscopy. Article; Current Directions in Biomedical Engineering 2021;7(1): 20211134
  
• V. Bruns, R.Huss, P. Kuritcyn, M. Benz, A. Ebigbo, A. Probst, Ch. Palm, Th. Wittenberg, C. Geppert, A. Hartmann, H. Messmann, B. Märkl: Adapting an Adenocarcinoma-trained Tissue Cartography AI model to low- and high-grade adenoma. 06/08-12/2021; Poster; Virtuelle Pathologietage 2021
  
• Niedermair, B. Müller, D. Vermeulen, K. Steiger, C. Delbridge, K. Evert, K. Utpatel, M. Babel, F. Heimberg, M. Mayer, T. Eixelberger, V. Bruns, P. Schüffler, W. Weichert, M. Evert, C. Brochhausen: Digitalization of the workflows in pathology – process analyses as a fundamental approach for a successful roadmap (PathoScan).06/08-12/2021; Presentation; Virtuelle Pathologietage 2021
• Petr Kuritcyn, Michaela Benz, Jakob Dexl, Volker Bruns, Arndt Hartmann, Carol Geppert: Comparison of CNN models on a multi-scanner database in colon cancer histology. 07/07-09/2021; Presentation; Medical Imaging with Deep Learning; Lübeck
• Michaela Benz, Volker Bruns, Moritz Schillinger, Christian Hammer, Christopher Kussin, Verena Kaiser, Nathalie Wojtalewicz, Patrick Schwarz, Ingo Schellenberg, Ulrike Loderstädt, Christine Wegner, Birgit Förster, Egbert Tannich: A web-based platform for training and quality control of parasite microscopy. 07/09-12/2021; Abstract; ECCMID 2021
• Pantea Pour Farid, Markus Eckstein, Susanne Merkel, Robert Grützmann, Arndt Hartmann, Volker Bruns, Michaela Benz, Regine Schneider-Stock and Carol I. Geppert: Novel Criteria for Intratumoral Budding with Prognostic Relevance for Colon Cancer and Its Histological Subtypes , Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 13108. https://doi.org/10.3390/ijms222313108  ,PMID: 34884913  

• R. Hackner , S. Walluscheck, E. Lehmann, M. Raithel, V. Bruns, T. Wittenberg: AI-based 3D-reconstruction of the colon from monoscopic colonoscopy videos - First results. 12/2020; Conference; CARS 2020-Computer Assisted Radiology and Surgery Proceedings of the 34th International Congress and Exhibition; 
  
• Ralf Hackner and Sina Walluscheck; Edgar Lehmann, Thomas Eixelberger, Thomas Wittenberg: A Geometric and Textural Model of the Colon as Ground Truth for Deep-Learning Based 3D-Reconstruction. 11/2020; Bildverarbeitung für die Medizin 2021; Springer Professional;  Wiesbaden; ISBN: 978-3-658-33197-9
  
• Petr Kuritcyn, Carol I. Geppert, Markus Eckstein, Arndt Hartmann,
  Volker Bruns, Jakob Dexl, Serop Baghdadlian, David Hartmann,
  Dominik Perrin, Thomas Wittenberg, Michaela Benz: Robust slide cartography in colon cancer histology - Evaluation on a multi-scanner database. 11/2020; Article; Bildverarbeitung für die Medizin 2021; Springer Professional;  Wiesbaden; ISBN: 978-3-658-33197-9
  
• Steinert, J.; Wittenberg, T.; Bednarzig, V.; Detsch, R.; Claussen, J.; Gerth, S.: CT-based non-destructive quantification of 3D-printed hydrogel implants. 03/15/2020; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM); 119-124; Springer Fachmedien; DOI: 10.1007/978-3-658-29267-6_25
• Eixelberger, T.; Parchent, J.; Janka, R.; Stamminger, M.; Döllinger, M.; Wittenberg, T.: Haptic rendering of soft-tissue for training surgical procedures at the larynx. 3/15/2020; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM); 342-347; Springer Fachmedien; DOI: 10.1007/978-3-658-29267-6_76
• Weiherer, M.; Zorn, M.; Wittenberg, T.; Palm, C.: Retrospective color shading correction for endoscopic images. 3/15/2020; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM); 14-19; Springer Fachmedien; DOI: 10.1007/978-3-658-29267-6_3
• Ralf Hackner, Martin Raithel, Edgar Lehmann, Thomas Wittenberg: Deep-learning based reconstruction of the stomach from monoscopic video data. 03/2020; Article; Current Directions in Biomedical Engineering; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2020-3012
  
• Magnus Rathke, Pascal Zobel, Volker Bruns, Steffen Mühldorfer, Thomas Wittenberg (2020): Computer Assistierte Erkennung von Polypen mit tiefen Neuronalen Netzen. =1/2020; Abstract und Poster bei der DGE-BV 2020 in Würzburg, Endoscopy Campus (EC) Magazin, 1.2020; S. 80-81.
  https://www.endoscopy-campus.com/wp-content/uploads/ec-magazin-2020-01.pdf
• Thomas Wittenberg, Martin Raithel (2020): Artificial Intelligence-Based Polyp Detection in Colonoscopy – Where Do We Come from, Where Do We Stand, and Where Will We Go to? Article; Visceral Med. Visc Med 2020. DOI: 10.1159/000512438

• Weißkopf, Peter; Koch, Robert; Haßlmeyer, Erik; Hauenstein, Thomas; Wagner, Eugen; Lang, Nadine; Garbas, Jens- Uwe; Wittenberg, Thomas; Struck, Matthias: Robust contactless optical heart rate acquisition - measuring human perception in minimal invasive settings. 9/25/2019; Conference; Proceedings, Biomed. Eng.-Biomed. Tech. 2019 - Proceedings BMT 2019; DeGruyter Verlag; DOI 10.1515/bmt-2019-6023
• Rüger, Steffen; Firsching, Markus; Lucic, Julija; Ennen, Alexander; Uhlmann, Norman; Wittenberg, Thomas: Automated detection of bone splinters in DEXA phantoms using deep neural networks. 9/18/2019; Article; 281–284; Current Directions in Biomedical Engineering, Band 5; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2019-0071
• Zobel, Pascal; Rathke, Magnus; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Computer Aided Detection of Polyps in Whitelight- Colonoscopy Images using Deep Neural Networks. 9/18/2019; Article; 231-234; Current Directions in Biomedical Engineering, Band 5; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2019-0059
• Killguß, Nathalie; Wittenberg, Thomas; Rupp, Robin (ENT Clinics University Erlangen); Hofer, Mathias (University of Leipzig); Franz, Daniela; Eixelberger, Thomas: Interactive Image Segmentation for Cochlea Implant Planning based on DVT Data. 9/18/2019; Article;
  413–416; Current Directions in Biomedical Engineering 2019, Band 5; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2019-0104
• Bergler, Matthias; Benz, Michaela; Rauber, David; Hartmann, David; Kötter, Malte (Universitätsklinikum Erlangen); Eckstein, Markus (Universitätsklinikum Erlangen); Schneider-Stock, Regine (Universitätsklinikum Erlangen); Hartmann, Arndt (Universitätsklinikum Erlangen); Merkel, Susanne (Universitätsklinikum Erlangen); Bruns, Volker; Wittenberg, Thomas; Geppert, Carol (Universitätsklinikum Erlangen): Automatisierte Tumor Bud Quantifizierung in Pan-Cytokeratin gefärbtem Kolonkarzinom. 6/13/2019; Conference; Der Pathologe, Abstractband der 103. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie; 83-84; Springer Medizin
  
• Bruns, Volker; Eixelberger, Thomas; Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Mit allen Sinnen lernen: Auf dem Weg zur fehlerfreien Operation - Entwicklung eines virtuellen OP-Trainers zur Unterstützung von Chirurgen in der Neuro-, HNO- und MKG-Chirurgie. 5/1/2019; Article; 17-20; KU Gesundheitsmanagement
• Bergler, Matthias; Benz, Michaela; Rauber, David; Hartmann, David; Kötter, Malte (University Hospital Erlangen); Eckstein, Markus (University Hospital Erlangen); Schneider-Stock, Regine (University Hospital Erlangen); Hartmann, Arndt (University Hospital Erlangen); Merkel, Susanne (University Hospital Erlangen); Bruns, Volker; Wittenberg, Thomas; Geppert Carol (University Hospital Erlangen): Automatic Detection of Tumor Buds in Pan-Cytokeratin stained Colorectal Cancer Sections by a Hybrid Image Analysis Approach. 4/10/2019; Conference; Proceedings, 15th European Congress on Digital Pathology (ECDP 2019), Warwick, UK, Proceedings; Lecture Notes in Computer Science; 83-90; Springer International Publishing; DOI: 10.1007/978-3-030-23937-4_10
• Wittenberg, Thomas; Bruns, Volker; Wiesmann, Veit: Auswertung von Fluoreszenzmikroskopie Aufnahmen in der Medizin. 1/1/2019; Article; Fraunhofer Vision Nr. 19 - Leitfaden zur hyperspektralen Bildverarbeitung; Fraunhofer-Allianz Vision Leitfaden; 82-85; Fraunhofer Verlag, Stuttgart; ISBN: 978-3-8396-1502-7
• Bruns, Volker; Geppert, Carol (Universitätsklinikum Erlangen): Einsatz von Künstlicher Intelligenz in der digitalen Pathologie - Auf dem Sprung in die Routine? 1/1/2019; Article; 91-93; Trillium Diagnostik
• Klare, P.; Sander, C.; Prinzen, M.; Haller, B.; Nowack, S.; Abdelhafez, M.; Poszler, A.; Brown, H.; Wilhelm, D.; Schmid, R.M.; Delius, S. von; Wittenberg, T.: Automated polyp detection in the colorectum: A prospective study (with videos). 2019; Article; Gastrointestinal endoscopy 89, Nr.3; 576-582; DOI: 10.1016/j.gie.2018.09.042
• Eckstein, M.; Sailer, V.; Schnack Nielsen, B.; Wittenberg, T.; Wiesmann, V.; Lieb, V.; Nolte, E.; Hartmann, A.; Kristiansen, G.; Wernert, N.; Wullich, B.; Taubert, H.; Wach, S.: Co-staining of microRNAs and their target proteins by miRNA in situ hybridization and immunohistofluorescence on prostate cancer tissue microarrays. 2019; Article; Laboratory investigation 99, Nr.10, 1527-1534; DOI: 10.1038/s41374-019-0251-8
• Katanacho, Manuel; Beteiligt: Krüger, Jörg; Uhlmann, Eckart; Wittenberg, Thomas: Verfahren zur kamerabasierten Instrumentennavigation am Beispiel der HNO-Chirurgie. 2019; Dissertation; 139; Berichte aus dem Produktionstechnischen Zentrum Berlin; ISBN: 978-3-8396-1498-3
• Bruns, Volker; Eixelberger, Thomas; Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Mit allen Sinnen lernen: Auf dem Weg zur fehlerfreien Operation - Entwicklung eines virtuellen OP-Trainers zur Unterstützung von Chirurgen in der Neuro-, HNO- und MKG-Chirurgie (PDF) . 07/17/2019; Article; KU Gesundheitsmanagement; 17-20; Verband der Krankenhausdirektoren Deutschlands e.V.; ISSN: 0023-4508

• Franz, D.; Dreher, M.; Prinzen, M.; Teßmann, M.; Palm, C.; Katzky, U.; Perret, J.; Hofer, M.; Wittenberg, T.: CT-basiertes virtuelles Fräsen am Felsenbein: Bild- und haptischen Wiederholfrequenzen bei unterschiedlichen Rendering Methoden. 03/13/2018; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2018 : Algorithmen - Systeme - Anwendungen; 176-181; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_51
• Wittenberg, T.: Endoscopy. 03/13/2018; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2018: Algorithmen - Systeme - Anwendungen; S. 8; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_8
  
• Maier, J.; Huber, M.; Katzky, U.; Perret, J.; Wittenberg, T.; Palm, C.: Force-feedback-assisted bone drilling simulation based on CT data. 03/13/2018; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2018: Algorithmen - Systeme - Anwendungen; 291-296; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_78
• Unterer, B.; Wiesmann, V.; Gunasekaran, M.; Sticht, H.; Tenkerian, C.; Behrens, J.; Leone, M.; Engel, F.B.; Britzen-Laurent, N.; Naschberger, E.; Wittenberg, T.; Stürzl, M.: IFN-γ-response mediator GBP-1 represses human cell proliferation by inhibiting the Hippo signaling transcription factor TEAD. Article; Biochemical Journal 475, Nr. 18, 2955-2967; DOI: 10.1042/BCJ20180123
• Avenhaus, Malte; Benz, Michaela; Bergen, Tobias; Ernst, Andreas; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas; Zilly, Frederik: Image processing device and method for producing in real-time a digital composite image from a sequence of digital images of an interior of a hollow structure. 2018; Patent
• Bergler, Matthias; Weiherer, Maximilian (OTH Regensburg); Bergen, Tobias; Avenhaus, Malte; Rauber, David (OTH Regensburg); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Benz Michaela: Stitching pathological tissue images using DOP feature tracking. 3/5/2018;  Conference; Bildverarbeitung für die Medizin 2018. Proceedings des Workshops vom 11. bis 13. März 2018 in Erlangen; Informatik Aktuell; 322-327; Springer Vieweg;  DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_84

• Wittenberg, Thomas: Panorama und 3D Endoskopie; 4/1/2017; Lecture;  Munich; Germany
• Aichinger, W.; Krappe, S.; Cetin, A.E.; Cetin-Atalay, R.; Üner, A.; Benz, M.; Wittenberg, T.; Stamminger, M.; Münzenmayer, C.: Automated cancer stem cell recognition in H and E stained tissue using convolutional neural networks and color deconvolution.; 02/12/2017; Conference;  Proceedings; SPIE 10140, Medical Imaging 2017: Digital Pathology; DOI: 10.1117/12.2254036
  
• Krappe, Sebastian; Benz, Michaela; Gryanik, Alexander; Tannich, Egbert (Bernhard-Nocht Institut für Tropenmedizin (BNITM) Hamburg); Wegner, Christine (BNITM); Stamminger, Marc (Friedrich-Alexander-University Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Automated plasmodia recognition in microscopic images for diagnosis of malaria using convolutional neural networks. 2/11/2017; Conference; Proceedings; SPIE 10140, Medical Imaging 2017: Digital Pathology; DOI: 10.1117/12.2249845
• Kriegmair, M.C.; Bergen, T.; Ritter, M.; Mandel, P.; Michel, M.S.; Wittenberg, T.; Bolenz, C.: Digital Mapping of the Urinary Bladder: Potential for Standardized Cystoscopy Reports. 2017; Urology 104; 235-241; DOI: 10.1016/j.urology.2017.02.019
• Schulz-Wendtland, Rüdiger; Harz, Markus; Meier-Meitinger, Martina; Brehm, Barbara; Wacker, Till; Hahn, Horst; Wagner, Florian; Wittenberg, Thomas; Beckmann, Matthias; Uder, Michael; Fasching, Peter; Emons, Julius: Semi-automated delineation of breast cancer tumors and subsequent materialization using three-dimensional printing (rapid prototyping). 2017; Journal of surgical oncology 115; Vol. 3; 238-242; DOI: 10.1002/jso.24510
• Häberle, L.; Hack, C.C.; Heusinger, K.; Wagner, F.; Jud, S.M.; Uder, M.; Beckmann, M.W.; Schulz-Wendtland, R.; Wittenberg, T.; Fasching, P.A.: Using automated texture features to determine the probability for masking of a tumor on mammography, but not ultrasound. 2017; Arrticle; European journal of medical research 22; DOI: 10.1186/s40001-017-0270-0
• Wiesmann, Veit; Bergler, Matthias; Palmisano, Ralf (Univ. Erlangen); Prinzen, Martin; ranz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Using simulated fluorescence cell micrographs for the evaluation of cell image segmentation algorithms. 3/18/2017; Article; BMC Bioinformatics; DOI: 10.1186/s12859-017-1591-2
• Münzenmayer, Christian; Gryanik, Alexander; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas: Verfahren und Vorrichtung zum Erstellen einer Mikroskopiepanoramadarstellung. 2017; Patent
  
• Ott, L.; Hacker, E.; Kunert, T.; Karrington, I.; Etschel, P.; Lang, R.; Wiesmann, V.; Wittenberg, T.; Singh, A.; Varela, C.; Bhatt, A.; Sangal, V.; Burkovski, A.: Analysis of Corynebacterium diphtheriae macrophage interaction.; 2017; Article; PLoS one. Online journal 12; DOI: 10.1371/journal.pone.0180105

• Schulz-Wendtland, Rüdiger (University Hospital Erlangen); Harz, Markus (Fraunhofer MEVIS); Meier-Meitinger, Martina (University Hospital Erlangen); Brehm, Barbara (University Hospital Erlangen); Wacker, Till (FAU Erlangen); Hahn, Horst (Fraunhofer MEVIS); Wagner, Florian; Wittenberg, Thomas; Beckmann, Matthias (University Hospital Erlangen); Uder, Michael (University Hospital Erlangen); Fasching, Peter (University Hospital Erlangen); Emons, Julius (University Hospital Erlangen): Semi-Automated Delineation of Breast Cancer Tumors and Subsequent Materialization Using Three-Dimensional Printing (Rapid Prototyping). 12/14/2016; Article; Journal of Surgical Oncology; DOI: 10.1002/jso.24510
• Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: From OR-Planning to OR-Simulation for Cochlea Implants. 9/30/2016; Lecture; Bern, Switzerland
• Sandvoss, Jan; Wittenberg, Thomas; Nowack, Arne; Ernst, Jürgen: 3D-Reconstruction by Polarization Imaging in Endoscopy. 9/29/2016; Conference; 15. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2016); 53-57; Der Andere Verlag; ISBN: 978-3-86247-595-7
• Wittenberg, Thomas: Aktueller Stand Immersiver 3D-Technologien für die Medizin. 9/29/2016; Lecture; Bern, Switzerland
• Erpenbeck, Daniel; Wittenberg, Thomas; Rosenthal, Jean-Claude (Fraunhofer HHI); Kauff, Peter (Fraunhofer HHI); Lemke, Niels (Schölly Fiberoptic GmbH); Bergen, Tobias: Evaluierung von 3D-Rekonstruktionsverfahren in der Stereo-Laparoskopie. 9/29/2016; Conference; 15. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2016); 58-63; Der Andere Verlag; ISBN: 978-3-86247-595-7
• Franz, Daniela; Katzky, Uwe (szenaris GmbH); Neumann, Sabine (SeeFront GmbH); Peret, Jerome (Haption GmbH); Hofer, Mathias (HNO Klinik Leipzig); Huber, Michaela (UK Regensburg); Schmitt-Rüth, Stephanie; Haug, Sonja (OTH Regensburg); Weber, Karsten (OTH Regensburg); Prinzen, Martin; Palm, Christoph (OTH Regensburg); Wittenberg, Thomas: Haptisches Lernen für Cochlea Implantationen Konzept – HaptiVisT Projekt. 9/29/2016; Conference; 15. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2016); 21-26; Der Andere Verlag; ISBN: 978-3-86247-595-7
• Wittenberg, Thomas; Erpenbeck, Daniel, Brischwein, Matthias; Hagen; Eigl, Benjamin; Bergen, Tobias: Panoramaendoskopie – Von 2D zu 3D: Ein Update. 9/29/2016; Lecture; Bern, Switzerland
• Spinnler, Klaus; Bergen, Tobias; Sandvoss, Jan; Wittenberg, Thomas: Digital Image Processing for the Automation of NDT by Means of Endoscopy. 6/13/2016; Conference; Proceedings, 19th World Conference on Non-Destructive Testing (WCNDT 2016); 1168-1175; ISBN: 978-3-940283-78-8
• Krappe, Sebastian; Leisering, Richard; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Automatic Detection of Relevant Regions for the Morphological Analysis of Bone Marrow Slides. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016; Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuel; l272-276; Springer Vieweg; DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_48
• Erpenbeck, Daniel; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Tannich, Egbert (Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine (BNITM), Hamburg); Wegner, Christine (BNITM); Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Basic statistics of SIFT features for texture analysis. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016; Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuell; 98-103; Springer Vieweg; DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_19
• Wiesmann, Veit; Groß, Christine (Institute of Clinical and Molecular Virology, Erlangen); Franz, Daniela; Thoma-Kreß, Andrea K. (Institute of Clinical and Molecular Virology); Wittenberg, Thomas: Combining Active Contours and Active Shapes for Segmentation of Fluorescently Stained Cells. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016. Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuell; 122-127; Springer Vieweg; DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_23
• Dach, Claudia; Rau, Tilmann (Institute of Pathology, Bern); Geppert, Carol (Institute of Pathology, Erlangen); Hartmann, Alexander (Institute of Pathology, Erlangen); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Towards Computer-Assisted Diagnosis of Precursor Colorectal Lesions. 3/13/2016; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2016. Algorithmen - Systeme - Anwendungen;  Informatik aktuell; 266-271; Springer Vieweg;  DOI: 10.1007/978-3-662-49465-3_47
• Kriegmair, Maximilian (UK Mannheim); Wittenberg, Thomas; Ritter, Manuel (UK Mannheim); Michel, Maurice (UK Mannheim); Bolenz, Christian (UK Ulm); Bergen, Tobias: Generating panoramic images of the urinary bladder for the digital documentation of cystoscopy findings using Endorama®: Development and first clinical experience. 3/1/2016; Article; European Urology Supplements; DOI: 10.1016/S1569-9056(16)60033-7
• Krappe, Sebastian; Wittenberg, Thomas; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Münzenmayer, Christian: Automated morphological analysis of bone marrow cells in microscopic images for diagnosis of leukemia: nucleus-plasma separation and cell classification using a hierarchical tree model of hematopoesis. 2/27/2016; Conference; Proceedings, SPIE 9785, Medical Imaging 2016: Computer-Aided Diagnosis; DOI: 10.1117/12.2216037
  
• Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas: Stitching and Surface Reconstruction from Endoscopic Image Sequences: A Review of Applications and Methods. 1/1/2016; Article; 304-321; IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics; DOI: 10.1109/JBHI.2014.2384134

• Franz, Daniela; Syré, Liane; Bischoff, Barbara (University Hospital Erlangen); Hastreiter, Peter (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas: Preoperative Planning of Neurovascular Compression Syndrome Surgery based on an Interactive Wizard-Based Segmentation Approach – Extended Evaluation Results. 9/17/2015; Conference; 14. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie e.V. (CURAC 2015); 195-200; ISBN: 978-3-00-050359-7
• Nowack, Sebastian; Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian; Raithel, Martin (Universitätsklinikum Erlangen); Prinzen, Martin; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Unterscheidung von Polypen und Hintergrundgewebe in statischen Koloskopieaufnahmen. 9/17/2015; Conference; 14. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie e.V. (CURAC 2015)
  201-204; ISBN: 978-3-00-050359-7
• Brischwein, Matthias; Wittenberg, Thomas; Bergen, Tobias: Image Based Reconstruction for Cystoscopy. 9/16/2015; Article; 470-474; De Gruyter Verlag; DOI: 10.1515/cdbme-2015-0113
• Krappe, Sebastian; Sahin, Yesim; Bindl, Thomas; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: An interactive app for training and qualification in differentiating blood cells. 9/11/2015; Article; 361; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; De Gruyter Verlag
• Sonntag, Daniel (DKFI); Tresp, Volker (Siemens); Zillner, Sonja (Siemens); Cavallaro, Alexander (UK Erlangen); Hammon, Matthias (UK Erlangen); Reis, André (UK Erlangen); Fasching, Peter (UK Erlangen); Sedlmayr, Martin (UK Erlangen); Ganslandt, Thomas (UK Erlangen); Prokosch, Hans Ullrich (UK Erlangen); Budde, Klemens (Charité Berlin); Schmidt, Danilo (Charité Berlin); Hinrichs, Carl (Charité Berlin); Wittenberg, Thomas; Daumke, Philipp (Fa. Averbis); Oppelt, Philipp (IFG Erlangen): The Clinical Data Intelligence Project – A Smart Data Initiative. 8/1/2015; Article; Informatik-Spektrum; Springer Veerlag; DOI: 10.1007/s00287-015-0913-x
• Wittenberg, Thomas: Computergestützte Bildverarbeitung und Mustererkennung für die diagnostische und interventionelle Endoskopie. 4/24/2015; Lecture; Leipzig, Germany
• Wittenberg, Thomas: OP 2025 – Die Chirurgie von Morgen. 4/15/2015; Lecture; Tuttlingen, Germany
• Prinzen, Martin; Trost, Jonas; Bergen, Tobias; Nowack, Sebastian; Wittenberg, Thomas: 3D Shape Reconstruction of the Esophagus from Gastroscopic Video. 3/15/2015; CoConference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell;  173-178; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_31
• Krappe, Sebastian; Münzenmayer, Christian; Evert, Amrei; Fahrettin Koyuncu, Can (Bilkent University Ankara); Cetin, Enis (Bilkent University Ankara); Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Wittenberg, Thomas; Held, Christian: Dynamic Programming for the Segmentation of Bone Marrow Cells. 3/15/2015;  Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Informatik aktuell 2015; 359-36; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_62
• Prinzen, Martin ; Raithel, Martin (University Medical Center Erlangen); Bergen, Tobias; Mühldorfer, Steffen (Medical Center Bayreuth); Nowack, Sebastian; Wilhelm, Dirk (Technical University Munich); Wittenberg, Thomas: Panorama Mapping of the Esophagus from Gastroscopic Video. 3/15/2015; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell; 455-460; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_78
• Franz, Daniela; Hüttmayer, Hanna; Stamminger, Marc (University of Erlangen-Nuremberg); Wiesmann, Veit; Wittenberg, Thomas: The Cell-Shape-Wizard. User Guidance for Active Contour-based Cell Segmentation. 3/15/2015; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell; 341-346; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_59
• Franz, Daniela; Syré, Liane; Paulus, Dietrich (University of Koblenz and Landau); Bischoff, Barbara (University Hospital Erlangen), Wittenberg, Thomas; Hastreiter, Peter (University Hospital Erlangen): The SIP-NVC-Wizard. User Guidance on Segmentation for Surgical Intervention Planning of Neurovascular Compression. 3/15/2015; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Informatik Aktuell;  65-70; Springer Verlag;  DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_13
  
• Krappe, Sebastian; Evert, Amrei; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Held, Christian; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Smear detection for the automated image-based morphological analysis of bone marrow samples for leukemia diagnosis. 3/11/2015; Conference; Proceedings, Forum Life Science 2015
  
• Krappe, Sebastian; Benz, Michaela; Wittenberg, Thomas; Haferlach, Torsten (MLL Munich Leukemia Laboratory); Münzenmayer, Christian: Automated classification of bone marrow cells in microscopic images for diagnosis of leukemia: A comparison of two classification schemes with respect to the segmentation quality. 2/21/2015; Conference; Proc. SPIE 9414, Medical Imaging 2015: Computer-Aided Diagnosis; DOI: 10.1117/12.2081946
  
  

• Struck, Matthias; Hofmann, Christian; Wittenberg, Thomas: Textile Bewegungserfassung und -parameter. 11/22/2014; Lecture; Erlangen, Germany
• Wiesmann, Veit; Franz, Daniela; Held, Christian; Münzenmayer, Christian; Palmisano, Ralf; Wittenberg, Thomas: Review of free software tools for image analysis of fluorescence cell micrographs. 11/1/2014; Article; Journal of Microscopy; DOI: 10.1111/jmi.12184
  
• Wittenberg, Thomas; Brischwein, Matthias; Nowack, Sebastian; Chen, Grace (The Johns Hopkins Medical School, Baltimore); Bergen, Tobias: Panoramabildgebung der Blase: Vom Phantom zu präklinischen Experimenten10/28/2014; Article; 146–150; Endoskopie Heute; DOI: 10.1055/s-0034-1385113
• Dach, Claudia; Erpenbeck, Daniel; Rademacher, Thomas (Fraunhofer IME); Reimann, Andreas (Fraunhofer IME); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Assessment of the plant health status based on hyperspectral and color image analysis towards the cGMP-compliant large-scale production of biopharmaceuticals in plants. 10/14/2014; Article; 563-566; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5008
• Franz, Daniela; Wiesmann, Veit; Stamminger, Marc (University Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas: Cell-Shape Wizard – A Concept for User-Guidance for Active Shape Segmentation in Fluorescence Cell Micrographs. 10/14/2014; Article; 877-880; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5011
• Erpenbeck, Daniel; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Development and evaluation of passive autofocus algorithms in the field of automated microscopy. 10/14/2014; Article; 559-562; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5008
• Wiesmann, Veit; Bergler, Matthias; Palmisano, Ralf (Optical Imaging Center Erlangen); Prinzen, Martin; Franz, Daniela; Wittenberg, Thomas: Enhanced Fluorescent Cell Simulation using Texture Mapping and Statistical Shape Model. 10/14/2014; Article; 959-958; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik; DOI: 10.1515/bmt-2014-5012
• Bergen, Tobias; Trost, Jonas; Wittenberg, Thomas: Entropy based image blending for endoscopic panorama imaging in cystoscopy1. 0/14/2014; Article; 595-598; Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik
• Wittenberg, Thomas: Medizintechnik bei Fraunhofer: Eine Brücke zwischen Forschung und Industrie. 9/11/2014; Lecture; Munich, Germany
• Kuleschow, Andreas; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Optische Stabilisierung beim Laserabtrag in der handgeführten Kraniotomie. 9/11/2014; Conference; 13. CURAC Jahrestagung - Synergie durch Interdisziplinarität" (CURAC 2014)";
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• Bergen, Tobias; Hastreiter, Peter (University Clinics, Erlangen); Xu, Tengfei (University Clinics, Erlangen); Münzenmayer, Christian; Buchfelder, Michael (University Clinics, Erlangen); Wittenberg, Thomas: Real-time panorama imaging of sphenoid sinuses from monocular endoscopic views: an update based on clinical experiments. 9/11/2014; Conference; CURAC 2014 - Synergie durch Interdisziplinarität; 32-35; ISBN: 978-3-00-047154-4
• Tepfenhart, Ronald; Prinzen, Martin; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas; Nowack, Sebastian: Scharf und Gut! – Vergleich von Qualitätsmaßen für die digitale Koloskopie. 9/11/2014; Conference; 13. CURAC Jahrestagung - Synergie durch Interdisziplinarität; 36-39; ISBN: 978-3-00-047154-4
• Wittenberg, Thomas: Endoskopie. 6/1/2014; Article;
  Biomedizinische Technik - Medizinische Bildgebung; Biomedizinische Technik; 455-470; De Gruyter Verlag, Berlin; DOI: 10.1515/9783110252149.455

• Kondruweit, Markus (Center of Cardiac Surgery, Erlangen); Friedl, Sven; Heim, Christian (Center of Cardiac Surgery); Wittenberg, Thomas; Weyand, Michael (Center of Cardiac Surgery); Harig, Frank (Center of Cardiac Surgery): A New Ex Vivo Beating Heart Model to Investigate the Application of Heart Valve Performance Tools with a High-Speed Camera. 1/1/2014; Article; 38–43; ASAIO Journal; DOI: 10.1097/MAT.0000000000000008

• Bergen, Tobias; Hastreiter, Peter (University Clinics Erlangen); Münzenmayer, Christian; Buchfelder, Michael (University Clinics Erlangen); Wittenberg, Thomas: Image stitching of sphenoid sinuses from monocular endoscopic views. 11/28/2013; Conference; Tagungsband, 12. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2013)
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• Wittenberg, Thomas: Semi-automated wide field fluorescence microscopy image analysis. 9/26/2013;  Lecture; Erlangen, Germany
  
• Wiesmann, Veit; Sauer, Tobias; Held, Christian; Palmisano Ralph; Wittenberg, Thomas: Cell Simulation for Validation of Cell Micrograph Evaluation Algorithms. 9/22/2013; Conference, 47. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (BMT Jahrestagung); Biomedizinische Technik; DeGruyter Verlag; DOI: 10.1515/bmt-2013-4272
• Dach, Claudia; Friedl, Sven; Vieth, Michael (Klinikum Bayreuth); Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian; Hartmann, Arndt (Universität Erlangen-Nürnberg); Geppert, Carol (Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: CAD4GERD - Computer-Assisted Diagnostic for Gastroesophageal Reflux Disease – First Results. 9/1/2013; Conference, 58. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS2013)
  547-548; German Medical Science GMS Publishing House, Düsseldorf; DOI: 10.3205/13gmds263
• Krappe, Sebastian; Efstathiou, Efthymios; Haferlach, Torsten (MLL Münchner Leukämielabor GmbH); Macijewski, Katja (MLL); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Training und Qualitätssicherung für die morphologische Analyse von Knochenmarkpräparaten. 9/1/2013; Conference; 58. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS2013); German Medical Science GMS Publishing House, Düsseldorf; DOI: 10.3205/13gmds246
• Bergen, Tobias; Nowack, Sebastian; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas: A hybrid tracking approach for endoscopic real-time panorama imaging. 6/26/2013; Article; 352-354
• Wittenberg, Thomas: »OP 2025« – Operationssäle von Morgen. 6/18/2013; Lecture; Erlangen, Gerermany
• Uter, Wolfgang (University of Erlangen-Nuremberg); Benz, Michaela; Mayr, Andreas (University of Erlangen-Nuremberg); Gefeller, Olaf (University of Erlangen-Nuremberg); Pfahlberg, Annette (University of Erlangen-Nuremberg): Assessing skin pigmentation in epidemiological studies: The reliability of measurements under different conditions. 5/1/2013; Article; 100-106; Skin Research and Technology; DOI: 10.1111/srt.12013
• Held, Christian; Wiesmann, Veit; Palmisano, Ralf (Optical Imaging Center, Erlangen); Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas: Interactive learning image analysis with application to fluorescence microscopy. 3/13/2013; Conference, Forum Life Science 2013
• Kage, Andreas; Muehldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Bergen, Tobias; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas: The importance of image quality assessment for the creation of reference image collection for computer-assisted diagnosis in colonoscopy. 1/26/2013; Article; 405-406;  DOI: 10.1007/s11548-013-0883-x
• Deserno, Thomas (RWTH Aachen); Handels, Heinz (Universtät Lübeck); Maier-Hein, Klaus (DKFZ Heidelberg); Mersmann, Sven (DKFZ Heidelberg); Palm, Christoph (HS Regensburg); Tolxdorff, Thomas (Charité Berlin); Wagenknecht, Gudrun (Forschungszentrum Jülich); Wittenberg, Thomas: Viewpoints on Medical Image Processing: From Science to Applications. 1/13/2013; Article; 79-88; Current Medical Imaging Reviews; DOI: 10.2174/1573405611309020002

• Weber, Norbert; Benz, Michaela; Ernst, Jürgen; Junger, Stephan; Neubauer, Harald: Polarisationskamera mit nanostrukturierten Bildsensoren macht Unsichtbares sichtbar. 12/1/2012; Article; S. 2728 - 2737; PLUS (Produktion von Leiterplatten Und Systemen) - Fachzeitschrift für Aufbau- und Verbindungstechnik in der Elektronik
• Weber, Norbert; Benz, Michaela; Ernst, Jürgen; Junger, Stephan; Neubauer, Harald: Polka öffnet den Blick ins Innere von Werkstoffen. 10/1/2012; Article; S. 32; Quality Engineering
• Mehlhorn, Grit (University Hospital Erlangen); Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela; Kage, Andreas; Beckmann, Matthias W. (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas: Computer-Assisted Diagnosis in Colposcopy: Results of a Preliminary Experiment? 9/27/2012; Artikel; 5. 54 – 559; Acta Cytologica; DOI: 10.1159/000341546
• Friedl, Sven; Geppert, Carol (Universitätsklinikum Erlangen); Hartmann, Arndt (Universitätsklinikum Erlangen); Paulsen, Friedrich (Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: A flexible virtual whole slide microscopy framework for distributed research. 9/16/2012; Conference; Proceedings, GMDS 2012: 57. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e. V. (GMDS); S. 279; Schattauer, Stuttgart; DOI: 10.3205/12gmds074
• König, Stefan; Kondruweit, Markus (Universitätsklinikum Erlangen); Weyand, Michael (Universitätsklinikum Erlangen); Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven: Detection and compensation of relative motion in endoscopic heart valve recordings by circular Hough transform. 9/16/2012; Conference; Proceedings, 57. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e.V. ; S. 242 - 243; Schattauer, Stuttgart
• Wiesmann, Veit; Held, Christian; Palmisano, Ralf (University Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas: Segmentation of HeLa cells in phase-contrast images with and without DAPI stained cell nuclei. 9/1/2012; Article; S. 519 - 522; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering
• Held, Christian; Wiesmann, Veit; Lengenfelder, Doris (University Erlangen-Nuremberg); Full, Florian (University Erlangen-Nuremberg); Palmisano, Ralf (University Erlangen-Nuremberg); Ensser, Armin (University Erlangen-Nuremberg), Wittenberg, Thomas: Automated high throughput image analysis of the ND10 complex of KSHV cells.8/31/2012; Article; S. 452 - 455; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering; DOI: 10.1515/bmt-2012-4049
• Friedl, Sven; Herdt, Eugen; Kondruweit, Markus (University Hospital Erlangen), Wittenberg, Thomas: Natural landmark tracking using triangle-based optical flow. 8/31/2012; Article; S. 695 - 697; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering
• Wittenberg, Thomas; Wagner, Florian; Gryanik, Alexander: Towards a Computer Assisted Diagnosis System for Digital Breast Tomosynthesis. 8/31/2012; Article; S. 223 - 226; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering
• Wittenberg, Thomas: Medizintechnik – Eine interdisziplinäre Herausforderung. 6/13/2012; Lecture; Munich, Germany
• Wittenberg, Thomas: Koloskopie : Technologien zur Endoskopischen Diagnostik und zukünftige Möglichkeiten. 6/12/2012; Lecture; Munich, Germany
  
• Friedl, Sven; Oehmke, Gregor (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas; Paulsen, Friedrich (University of Erlangen-Nürnberg); Hartmann, Arndt (University Hospital Erlangen); Geppert, Carol (University Hospital Erlangen): A web-based virtual microscopy platform as supplement for histopathology lectures. 5/31/2012; Conference; Tagungsband der Pathologie, 96. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie e.V.; S. 170; Springer Verlag
• Dach, Claudia; Geppert, Carol (University Erlangen), Friedl, Sven; Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian; Hartmann, Arndt (University Erlangen); Vieth, Michael (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Computer-assisted histology for the diagnosis of Barrett’s Esophagus – a pilot study. 5/31/2012; Conference; Tagungsband der Pathologie, 96. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pathologie e.V.;
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• Faschingbauer, Florian (Univ. Frauenklinik Erlangen); Beckmann, Matthias W. (Univ. Frauenklinik Erlangen); Weyert Goecke, Tamme (Univ. Fraunklinik Erlangen); Renner, Stefan (Univ. Frauenklinik Erlangen); Häberle, Lothar (Univ. Frauenklinik Erlangen); Benz, Michaela; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Automatic Texture-Based Analysis in Ultrasound Imaging of Ovarian Masses. 5/23/2012; Article; Epub ahead of print; Ultraschall in der Medizin; Georg Thieme Verlag KG; DOI: 10.1055/s-0031-1299331
• Dach, Claudia; Friedl, Sven; Geppert, Carol (Universität Erlangen); Gerlach, Sophia; Benz, Michaela; Hartmann, Arndt (Universität Erlangen); Münzenmayer, Christian; Vieth, Michael (Klinikum Bayreuth); Wittenberg, Thomas: Computer-Assistierte Histologie für die Diagnose von Barrett-Ösophagus – Eine Pilotstudie. 3/22/2012; Conference; Endoskopie Heute, Tagungsband, 42. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Endoskopie und Bildgebende Verfahren e.V.; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0032-1308777
• Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Ernst, Andreas: Gestenbasierte Interaktion zwischen Mensch und Maschine zur Segmentierung endoskopischer Bilder. 3/22/2012; Conference; Endoskopie Heute, Tagungsband, 42. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Endoskopie und Bildgebende Verfahren e.V.; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0032-1308723
• Friedl, Sven; Herdt, Eugen; König, Stefan; Weyand, Michael; Kondruweit, Markus; Wittenberg, Thomas: Determination of Heart Valve Fluttering by Analyzing Pixel Frequency. 3/18/2012; Conference; Proceedings, Workshop Bildverarbeitung für die Medizin 2012 - Algorithmen - Systeme - AnwendungenInformatik aktuell; S. 87 - 91; Springer Verlag, Berlin, Heidelberg
• Kage, Andreas; Legal, Wolfgang; Kelm, Peter; Simon, Jörg; Bergen, Tobias; Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela: Automatic Segmentation of lesions for the Computer-Assisted detection in fluorescence urology. 2/4/2012Conference; Proceedings, Medical Imaging 2012: Computer-Aided Diagnosis; DOI: 10.1117/12.911366
• Faschingbauer, Florian (UK Erlangen); Benz, Michaela; Häberl, Lothar (UK Erlangen) L, Goecke, Tamme (UK Erlangen); Beckmann, Matthias (UK Erlangen); Renner Stefan (UK Erlangen); Müller, Andreas (UK Erlangen), Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Subjective assessment of ovarian masses using pattern recognition: the impact of experience on diagnostic performance and interobserver variability. 1/20/2012; Article; 1663-9; Archives of Gynecology and Obstetrics; Springer Verlag; DOI: 10.1007/s00404-012-2229-2
• Gryanik, Alexander; Wittenberg, Thomas; Walles, Heike (Fraunhofer ISC), Steckhan, Dirk; Thude, Sybille (Fraunhofer ISC); Kaufmann, Michaela (Fraunhofer ISC); Münzenmayer, Christian: Automatic Image Quantification for Structural Analysis of in vitro Dermal Samples. 1/17/2012; Article; 494 - 497; Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering; Walther deGruyter Verlag
  
• Münzenmayer, Christian; Schlarb, Timo; Steckhan, Dirk; Haßlmeyer, Erik; Bergen, Tobias; Aschenbrenner, Stefan; Wittenberg, Thomas; Weigand, Christian; Zerfaß, ThorstenHema: CAM® - A Computer Assisted Microscopy System for Hematology. 1/1/2012;
  Microelectronic Systems - Circuits, Systems and Applications
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• Wittenberg, Thomas; Fuchs, Theobald: Visual Computing at the IIS: From Life Sciences to Industrial Applications. 1/1/2012;
  Microelectronic Systems - Circuits, Systems and Applications
  221 - 226; Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg; DOI: 10.1007/978-3-642-23071-4_21
  

• Schlötelburg, Cord (DGBMT); Feußner, Hubertus (TU München); Meining, Alexander (TU München); Meyer; Jörg-Uwe (Fa. MT2IT); Melzer, Andreas (Univ. Dundee); Wittenberg, Thomas: Chancen und Limitierungen von Closed-Loop-Systemen im OP. 12/21/2011; Article; 278–281; Endoskopie Heute; DOI: 10.1055/s-0031-1283809
• Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Computer-integrierte Endoskopie. 12/21/2011; Article; 271–277; Endoskopie heute; DOI: 10.1055/s-0031-1283834
• Wittenberg, Thomas: Endoskopie heute - Editorial. 12/21/2011; Article; 246 - 247; Endoskopie heute; DOI: 10.1055/s-0031-1283871
• Gryanik, Alexander; Wagner, Florian; Schulz-Wendtland, Ruediger (University of Erlangen-Nuremberg); Wittenberg, Thomas: Comparison of Manual and Automated Lesion Segmentation of Digital Breast Tomosynthesis Data – First Experiments. 10/11/2011; Conference; Proceedings, 7th Russian Bavarian Conference on Biomedical Engineering (RBC 2011); 191 - 196; Erlangen, Germany
• Kage, Andreas; Benz, Michaela; Münzenmayer, Christian: Computer Assisted Surgery in Fluorescence Endoscopy. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston; Freiburg, Germany
• Efstathiou, Efthymios; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Winter, Christian; Bergen,Tobias: Evaluation of 3D Ultrasound Registration. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston; Freiburg, Germany
• Dach, Claudia; Held, Christian; Palmisano, Ralf; Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven: Evaluation of input modalities for the interactive image segmentation of fluorescent micrographs. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston; Freiburg, Germany
• Bergen, Tobias; Winter, Christian; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Three dimensional Doppler ultrasound for liver surgery navigation. 9/27/2011; Conference; Proceedings, Biomed Tech 2011, 45. DGBMT Jahrestagung; Walter de Gruyter, Berlin, Boston Freiburg, Germany
  
• Dach, Claudia; Held, Christian; Wenzel, J (Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg); Lang, R (Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg); Friedl, Sven; Palmisano, Ralf (Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: Evaluierung der interaktiven Zellsegmentierung mit Hilfe des Graph Cuts Algorithmus in Fluoreszenz-Mikroskop-Bildern. 9/26/2011; Conference; Abstractband, 56. GMDS-Jahrestagung und 6. DGEpi-Jahrestagung,
  510-511; Mainz, Germany
• Friedl, Sven; Oehmke, Gregor; Wittenberg, Thomas; Hartmann, Arndt; Geppert, Carol: Freies Mikroskopieren im Web. 9/26/2011; Conference; Abstractband, 56. GMDS-Jahrestagung und 6. DGEpi-Jahrestagung; 177-178; Mainz, Germany
• Wenzel, Jens (University Hospital Erlangen); Held, Christian; Palmisano, Ralf (Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg); Teufel, Stefan (University Hospital Erlangen); David, Jean-Pierre (University Hospital Erlangen); Wittenberg, Thomas; Lang, Roland (University Hospital Erlangen): Measurement of TLR-induced macrophage spreading by automated image analysis: differential role of Myd88 and MAPK in early and late responses. 9/21/2011; Article; Frontiers in physiology2 (2011), Article 71; DOI: 10.3389/fphys.2011.00071
• Efstathiou, Efthymios; Deserno, Thomas ( RWTH Aachen); Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas; Bergen, Tobias: Evaluation of 3D Ultrasound Image Registration. 9/15/2011; Conference; Proceedings, 10. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC)
  17 - 20; Verlag Univ. Magdeburg; Magdeburg, Germany
• Kuleschow, Andreas; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: KLT Tracking zur schnellen Bewegungskorrektur auf Knochenoberflächen. 9/15/2011; Conference; Proceedings, 10. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC)
  53 - 56; Verlag Univ. Magdeburg; Magdeburg, Germany
• Friedl, Sven (University Hospital Erlangen); Morgus, Boris; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Wittenberg, Thomas; Bergen, Tobias: Landmark-based Feature Tracking for Endoscopic Motion Analysis. 9/15/20112011; Conference; Proceedings, 10. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC); 57-60; Verlag Univ. Magdeburg; Magdeburg, Germany
• Dach, Claudia; Held, Christian; Wenzel, Jens (Universität Erlangen-Nürnberg); Gerlach, Sophia; Lang, Roland (Universität Erlangen-Nürnberg); Palmisano, Ralf (Universität Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas: Evaluation of an interactive cell segmentation for fluorescence-microscopy based on the Graph Cut algorithm. 9/2/2011; Conference; Proceedings, 7th Workshop Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB 2011); Heidelberg, Germany
• Held, Christian; Wenzel, Jens (Univ. Erlangen); Webel, Rike (Univ. Erlangen); Marschall, Manfred (Univ. Erlangen); Lang, Roland (Univ. Erlangen); Palmisano, Ralf (Univ. Erlangen); Wittenberg, Thomas: Using Multimodal Information for the Segmentation of Fluorescent Micrographs with Application to Virology and Microbiology. 8/30/2011; Conference; Proceedings, 33rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS 2011); DOI: 10.1109/IEMBS.2011.6091601
• Wittenberg,Thomas; Kage, Andreas; Benz, Michaela; Winter, Christian; Koch, Martin (Universitätsklinik Erlangen); Beckmann, Matthias (Universitätsklinik Erlangen); Münzenmayer, Christian; Mehlhorn, Grit (Universitätsklinik Erlangen): GynCAD: Computer-Assisted Diagnosis for Colposcopy. 6/24/2011; Lecture; Berlin, Germany
  
• Friedl, Sven; Drechsler, Klaus (Fraunhofer IGD); Oyarzun, Laura Christina (Fraunhofer IGD); Kuleschow, Andreas; Kondruweit, Markus (University Hospital, Erlangen); Wittenberg, Thomas: A holistic approach using multimodal image-data for the support of cardiac surgery interventions.6/22/2011; Conference; Proceedings, 25th International Congress and Exhibition on Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS '11); 235 - 238; Springer Verlag; Berlin, Germany
• Bergen, Tobias; Efstathiou, Efthymios; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Winter, Christian: Geometric calibration of 3D ultrasound with a tracking system for volume stitching. 6/22/2011; Conference; Proceedings, 25th International Congress and Exhibition on Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS '11); 258 - 260; Springer Verlag; Berlin, Germany
• Ihlow, Alexander (Ilmenau University of Technology); Arndt, Daniel (Ilmenau University of Technology); Topf, Felix (Ilmenau University of Technology); Rothaug, Christoph (Ilmenau University of Technology); Wittenberg, Thomas; Heuberger, Albert (Ilmenau University of Technology): Photogrammetric Satellite Service Prediction – Correlation of RF Measurements and Image Data. 6/8/2011; Conference; Proceedings, IEEE International Symposium on Broadband Multimedia Systems and Broadcasting (BMSB 2011); S. 26; DOI: 10.1109/BMSB.2011.5954884
• Wittenberg, Thomas; Held, Christian; Dach, Claudia; Palmisano, Ralf: Automated and Interactive Learning Image Analysis for Fluorescent Micrographs. 4/12/2011; Lecture; Erlangen, Germany
• Friedl, Sven; König, Stefan; Kondruweit, Markus; Wittenberg, Thomas: Digital Kymography for the Analysis of the Opening and Closure Intervals of Heart Valves. 3/20/2011; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2011Informatik aktuell; 144 - 148; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_31
• Ihlow, Alexander (Ilmenau University of Technology); Held, Christian; Rothaug, Christoph (Ilmenau University of Technology); Dach, Claudia; Wittenberg, Thomas; Steckhan, Dirk: Evaluation of Expectation Maximization for the Segmentation of Cervical Cell Nuclei. 3/20/2011; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2011; Informatik aktuell; 139 - 143; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_30
• Held, Christian; Wenzel, Jens (Inst. für Immunologie u. Hygiene, Uni Erlangen); Ralf, Palmisano (Inst. für Immunologie u. Hygiene, Uni Erlangen); Lang, Roland (Inst. für Immunologie u. Hygiene, Uni Erlangen); Wittenberg, Thomas: Segmentierung von Makrophagen in Fluoreszenzbildern mittels Fast Marching Level Set Verfahren. 3/20/2011; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2011; Informatik aktuell; 129 - 133; Springer Verlag; DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_28
• Wittenberg, Thomas; Dach, Claudia; Friedl, Sven; Kage, Andreas; Winter, Christian; Münzenmayer, Christian: Barrett's Esophagus – No end of the »Hurley–Burley« - Image processing : A way out of the Dilemma? 3/18/2011; Lecture; Munich, Germany
• Benz, Michaela; Rojas-Solano, Jose (Thoraxklinik Heidelberg); Kage, Andreas; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Becker, Heinrich D. (Thoraxklinik Heidelberg): Computer-assistierte Diagnostik für die Bronchoskopie. 3/17/2011; Conference; Endoskopie heute - Forum bildgebender Verfahren; Proceedings, 41. Kongress der Deutschen Gesellschaft für Endoskopie und Bildgebende Verfahren e.V.; S. 79; Georg Thieme Verlag KG, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1275383
• Wittenberg, Thomas; Benz, Michaela; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian: Computer-unterstützte Diagnostik - Computer-assisted Diagnosis. 3/17/2011; Lecture; Munic, Germany
• Münzenmayer, Christian; Mühldorfer, Steffen (Klinikum Bayreuth); Engelhardt Lisa; Benz, Michaela; Wittenberg, Thomas: Bildbasierte Unterscheidung kolorektaler Polypen und Hintergrundgewebe mittels Farbtexturanalyse. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S. 60; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271225
• Wittenberg, Thomas; Stallkamp, Jan (Fraunhofer IPA): Closed-loop Surgery. 3/16/2011; Lecture; Munich, Germany
• Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Computational Endoscopy or 50 Years of unused Information in Endoscopy. 3/16/2011; Lecture; Munich, Germany
• Mehlhorn, Grit (Frauenklinik Erlangen); Münzenmayer, Christian; Benz, Michaela; Kage, Andreas; Koch, Martin (Frauenklinik Erlangen); Beckmann Matthias (Frauenklinik Erlangen); Wittenberg,Thomas: Computer-assistierte Diagnostik (CAD) für die Kolposkopie: Unterscheidung von Low-Grade, High-Grade und Tumor-Läsionen der Cervix uteri. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S.
  59; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271222
• Bergen, Tobias; Schneider, Armin (Klinikum r.d. Isar, München); Münzenmayer, Christian; Knödgen, Fritz (Klinikum r.d. Isar, München); Feussner, Hubertus (Klinikum r.d. Isar, München); Winter, Christian; Wittenberg, Thomas: Echtzeit-Stitching endoskopischer Bilder für eine erweiterte Sicht in chirurgischen Eingriffen. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S. 62; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271227
• Stallkamp, Jan (Fraunhofer IPA); Drechsler, Klaus (Fraunhofer IGD); Bergen, Tobias; Kaltenbacher, Dominik (Fraunhofer IPA); Burisch, Michael (Fraunhofer IGD); Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Sakas, Georgios (Fraunhofer IGD); Werner, Norman (Fraunhofer IPA); Wechsler, Axel (Fraunhofer IPA); Winter, Christian; Wittenberg, Thomas: Ein neues Konzept eines Integrierten Assistenzsystems für die navigierte Weichteilchirurgie. 3/16/2011; Conference; Endoskopie Heute; S. 62; Thieme Verlag, Stuttgart; DOI: 10.1055/s-0030-1271231
• Wittenberg, Thomas: Visual Computing in der medizinischen Diagnose und Therapie. 1/24/2011; Lecture; Coburg, Germany
  
  
  
  
  
  
  
  

• Mehlhorn, Grit (Frauenklinik der Universität Erlangen); Münzenmayer, Christian; Kage, Andreas; Benz, Michaela; Koch, Martin (Frauenklinik der Universität Erlangen); Winter, Christian; Beckmann, Matthias (Frauenklinik der Universität Erlangen); Wittenberg, Thomas: Computer-assistierte Diagnostik (CAD) für die Kolposkopie – Evaluation einer Pilotstudie. 12/22/2010; Article; S. 290 - 296; Endoskopie Heute; 2010, 23(4); DOI: 10.1055/s-0030-1262651
• Wittenberg, Thomas: Future of Medical Technologies for Endoscopy-based Interventions – Possible Influences from Applied Research. 11/19/2010; Lecture; Düsseldorf, Germany
• Benz, Michaela; Rojas-Solano, Jose R. (Thoraxklinik at Heidelberg University); Kage, Andreas; Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Becker, Heinrich D. (Thoraxklinik at Heidelberg University): Computer-Assisted Diagnosis for White Light Bronchoscopy: First Results. 10/29/2010; Conference; Table of Contents, Chest 2010; Vol. 138 no. 4 supp 433A; DOI: 10.1378/chest.10959
• Stallkamp, Jan (Fraunhofer IPA); Drechsler, Klaus (Fraunhofer IGD); Bergen, Tobias; Kaltenbacher, Dominik (Fraunhofer IPA); Burisch, Michael (Fraunhofer IGD); Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Sakas, Georgios (Fraunhofer IGD); Werner, Norman (Fraunhofer IPA); Wechsler, Axel (Fraunhofer IPA); Winter, Christian; Wittenberg, Thomas: Whole’O’Hand – A holistic intervention and interaction system: A novel concept for closed-loop liver surgery. 10/6/2010; Article; S. 27 - 31; Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering; Proceedings, BMT 2010, 44. DGBMT Jahrestagung, 3-Länder-Tagung D-A-CH, Rostock; 55 (Suppl.1 ), 2010; DOI 10.1515/BMT.2010.264
• Höller Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Schneider, Armin (Technical University, Munich); Jahn, Jasper; Guttierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Endoscopic Image Rectification using Gravity. 6/23/2010; Conference; International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery; S.
  247 - 248; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; Volume 5 / Suppl. 1; ISSN: 1861-6410; Geneva, Switzerland
• Arndt, Igor; Ernst, Andreas; Friedl, Sven; Kage, Andreas; Münzenmayer, Christian; Küblbeck, Christian; Wittenberg, Thomas: Gesture Based Segmentation of Medical Imagery for Sterile Environments: A new approach. 6/23/2010; Confernce; International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery; S. 407 - 409; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; Volume 5 / Suppl. 1; ISSN: 1861-6410; Geneva, Switzerland
  
• Tantinger, Daniel; Krassnig, Gerd; Weigand, Christian; Wittenberg, Thomas; Hofmann, Christian; Struck, Matthias: Automatische Erkennung und Klassifikation von Körperhaltungen und Aktivitäten. 5/19/2010; Conference; Kooperationsforum Intelligente Objekte und Mobile Informationssysteme im Gesundheitswesen; DOI: 10.3205/10iis04
• Krassnig, Gerd; Tantinger, Daniel; Hofmann, Christian ; Wittenberg, Thomas; Struck, Matthias: User-friendly system for recognition of activities with an accelerometer. 3/22/20102; Conference; Proc's 4th IEEE Int. Conf. on Pervasive Computing Technologies for Healthcare 'Pervasive Health 2010'; DOI: 10.4108/ICST.PERVASIVEHEALTH2010.8853
  
• Wittenberg, Thomas; Kage, Andras; Münzenmayer, Christian: CAD, Colposcopy and a little quiz… 3/20/2010; Lecture; Erlangen, Germany
  
• Barthold, Christine; Papst, Anton; Wittenberg, Thomas; Küblbeck, Christian; Lautenbacher, Stefan (Universität Bamberg); Schmid, Ute (Universität Bamberg); Friedl, Sven: Tracking von Gesichtsmimik mit Hilfe von Gitterstrukturen zur Klassifikation von schmerzrelevanten Action Units. 3/14/2010; Conference; Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2010 - Algorithmen, Systeme, Anwendungen (BMV 2010); Informatik aktuell; S. 455 - 459; SpringerBerlin, Heidelberg, New York; ISBN: 978-3-642-11967-5
  
• Mehlhorn, Grit (UKER); Münzenmayer, Christian; Kage, Andreas ; Benz, Michaela; Koch, Martin (UKER); Wittenberg, Thomas; Beckmann, Matthias (UKER): Evaluation einer Computer-assistierten Diagnostik (CAD) für die Kolposkopie - Daten einer Pilotstudie. 3/1/2010; Article; P. 204; Z.\ für Onkologie; Vol. 23, Suppl. 2; ISBN: 978-3-8055-9439-4
• Kondruweit, Markus (Herzchirurgische Klinik, Erlangen); Wittenberg, Thomas; Friedl, Sven; Tandler, Rene (Herzchirurgische Klinik, Erlangen); Weyand, Michael (Herzchirurgische Klinik, Erlangen): Description of a novel ex-vivo imaging and investigation technique to record, analyze and visualize heart valve motion under physiological conditions. 2/14/2010; Lecture; Stuttgart, Germany
  
• Wagner, Florian; Wittenberg, Thomas; Elter, Matthias: Classification of Mammographic Masses – Influence of Regions Used for Feature Extraction on the Classication Performance. 2/12/2010; Conference Proceedings, Medical Imaging 2010: Computer Aided Diagnosis; Vol. 7624; DOI: 10.1117/12.844675

• Wittenberg, Thomas: HemaCAM® – Computer-assistierte Mikroskopie für die Hämatologie -- Von der Idee bis zum System – Ein Rückblick. 11/20/2009; Lecture; Düsseldorf, Germany
• Friedl, Sven; Wittenberg, Thomas: MISS – ein konzeptioneller geschlossener Kreislauf für die minimal-invasive Herz-Chirurgie. 11/18/2009; Lecture; Düsseldorf, Germany
• Jahn, Jasper; Gutierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Schneider, Armin (Technical University Munich); Gillen, Sonja (Technical University Munich); Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Höller, Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Penne, Jochen (University Erlangen-Nuremberg); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Endoscopic Orientation Correction. 9/20/2009; Conference Proceedings, 12th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2009); London, UK; DOI: 10.1007/978-3-642-04268-3_57
• Jahn, Jasper; Gutierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Schneider, Armin (Technical University Munich); Gillen, Sonja (Technical University Munich); Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Höller, Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Penne, Jochen (University Erlangen-Nuremberg); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Clinical Evaluation of Endorientation: Gravity related rectification for endoscopic images. 9/16/2009; Conference; Konferenz IEEE Symposium 2009; Salzburg, Austria
  
• Rulsch, Martin; Benz, Michaela; Arzt, Christian; Podolak, Christian; Zhong, Jinghua; Couronné, Robert: A lightweight approach for activity classification on microcontrollers. 9/7/2009; Conference Proceedings, 11th International Congress of the IUPESM Medical Physics and Biomedical Engineering, World Congress 2009; Munich, Germany; DOI: 10.1007/978-3-642-03889-1_51
• Friedl, Sven; Wittenberg, Thomas; Kondruweit, Markus: Interactive Registration and Visualization of Cardiac Video and Angiography. 9/7/2009; Conference; Tagungsband IFMBE Proceedings WC 2009; S. 468 - 471; Springer Verlag, Heidelberg; 25/IV; DOI: 10.1007/978-3-642-03882-2-124
• Wittenberg, Thomas; Drechler, Klaus (Fraunhofer IGD); Kaltenbacher, Dominik (Fraunhofer IPA); Friedl, Sven; Rotinat-Libersa, Christine (CEA-LIST Paris); Reis, Christian (Fraunhofer IPA); DiBetta Marie (Fraunhofer IGD); Sakas, Georg (Fraunhofer IGD); Perrot, Yann (CEA LIST, Paris);Stallkamp, Jan ( Fraunhofer IPA); Kondruweit, Markus (Universitätsklinik, Erlangen): MISS Heart: Assisting Systems for Minimal Invasive Smart Suturing in Cardiac Surgery – A Conceptually Closed-Loop Approach. 9/7/2009; Conference; Tagungsband Proc's World Congress on Medical Physics \& Biomedical Engineering 2009 IFMBE Proceedings; S. 445-448; Springer Verlag, Heidelberg; 25/IV; ISBN: 978-3-642-03897-6
• Jahn, Jasper; Gutierrez, Javier; Wittenberg, Thomas; Schneider, Armin (Technical University Munich); Feußner, Hubertus (Technical University Munich); Höller, Kurt (University Erlangen-Nuremberg); Penne, Jochen (University Erlangen-Nuremberg); Hornegger, Joachim (University Erlangen-Nuremberg): Suppression of shock based errors with gravity related endoscopic image rectification. 7/29/2009; Conference Proceedings, Cardinal Health Retail Business Conference (RBC 2009); Washington D. C., USA
• Wittenberg, Thomas: Introduction to automated and interactive learning image-analysis for fluorescence-microscopy by the example of microbial effectors in host cells. 6/23/2009; Lecture; Erlangen, Germany
• Münzenmayer, Christian; Shevchenko, Nikita; Wittenberg, Thomas; Mühldorfer, Steffen: Sum- and difference-histogram Features versus Color and Position for Automated Polyp Recognition. 6/23/2009; Lecture; Berlin, Germany
• Wittenberg, Thomas: Computer based imaging analysis for endoscopic surgery. 6/17/2009; Lecture; Prague, Czech Republic
• Heidt, Sven-René von der (University of Koblenz); Elter, Matthias; Wittenberg, Thomas; Dietrich Paulus (University of Koblenz): Model-based characterization of mammographic masses. 3/22/2009; Conference Proceedings, Bildverarbeitung für die Medizin 2009 – Algorithmen, Systeme, Anwendungen; Informatik Aktuell; S. 287 - 291; Springer Verlag; Heidelberg, Berlin, New York; DOI: 10.1007/978-3-540-93860-6_58
• Elter, Matthias; Wittenberg, Thomas; Schulz-Wendtland, Rüdiger (University of Erlangen-Nürnberg); Deserno, Thomas M. (RWTH Aachen University): A multi-image approach to CADx of breast cancer with integration into PACS. 2/7/20092009; Conference; SPIE Medical Imaging 2009: Advanced PACS-based Imaging Informatics and Therapeutic Applications, Proceedings of SPIE 2009; Proceedings of SPIE; No. 7264-32; Vol. 7264; DOI: 10.1117/12.810983
• Kage, Andreas; Raithel, Martin (University of Erlangen-Nürnberg); Zopf, Steffen (University of Erlangen-Nürnberg); Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian: Narrow-Band Imaging for the Computer-Assisted Diagnosis in Patients with Barrett’s Esophagus. 2/7/2009; Conference; Medical Imaging 2009: Computer-Aided Diagnosis, Proceedings of SPIE Medical Imaging 2009; Proceedings of SPIE; No. 7260-138; Vol. 7260; DOI: 10.1117/12.812257
  

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• Wittenberg, Thomas; Becher, Florian Becher; Hensel Michael (Univ. Erlangen); Steckhan, Dirk: Image segmentation of cell nuclei based on classification in the color space. 11/23/2008; Conference Proceedings, 4th European Congress for Medical & Biological Engineering (eMBEC 2008) Engineering for Health IFMBE Proceeding; s 613 – 614; Springer Verlag; Berlin, Heidelberg; ISBN 978-3-540-89207-6
• Steckhan, Dirk; Bergen, Tobias; Wittenberg, Thomas; Rupp, Stephan: Robust image stitching for virtual microscopy. 8/20/2008; Conference Proceedings, 30th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (IEEE EMBC 2008); Vancouver, Canada; DOI: 10.1117/12.812144
  
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• Wittenberg, Thomas; Münzenmayer, Christian; Kage, Andreas; Elter, Matthias: Challenges and Developments of Computer Assisted Diagnosis (CAD) – Herausforderungen und Entwicklungen der Computer Assistierten Diagnose (CAD). 2/27/2008; Lecture; Mannheim, Germany
  
• Zerfaß, Thorsten; Rehn, Thomas; Wittenberg, Thomas: Boundary precise segmentation of nucleus and plasma of leukocytes. 2/16/20082008KonferenzbeitragKonferenzProceedings, SPIE Medical Imaging 2008: Image Processing; Vol. 6914; DOI: 10.1117/12.770370
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• Wittenberg, Thomas: Challenges and Developments of Computer Assisted Diagnosis. 1/1/2008; Lecture; Baltimore, USA
• Wittenberg, Thomas: Possible Puzzle-Pieces for the Fraunhofer-Carnot-Cooperation from Fraunhofer IIS. 1/1/2008; Lecture; Paris, France
• Wittenberg, Thomas; Kage, Andreas; Bergen, Tobias; Elter, Matthias; Münzenmayer, Christian: Computer-Assisted Diagnosis by Content-Based Image Retrieval – Clinical Use of Retrieval Systems and Databases. 1/1/2008; Lecture; Bamberg, Germany
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• Caulier, Yannick; Spinnler, Klaus; Bourennane, Salah (Université Aix-Marseille III); Wittenberg, Thomas: New Structured Illumination Technique for the Inspection of High-Reflective Surfaces: Application for the Detection of Structural Defects without any Calibration Procedures.1/1/2008; Article; EURASIP Journal on Image and Video Processing; Vol. 2008 (2008); DOI: 10.1155/2008/237459